大麦泛基因组的比较表观基因组学将结构变异与调控基因组功能联系起来

结构变异（SV）在植物基因组中广泛存在并影响农艺性状，然而，对其调控作用的解释仍然具有挑战性。在本研究中，我们结合了对20个大麦基因型开展的泛基因组范围DNA甲基化和染色质可及性分析，并在其中10个基因型中进一步补充了组蛋白修饰和染色质互作数据。 对基因型特异性表观基因组的比较分析表明，在整个大麦泛基因组中，DNA甲基化图谱总体上是保守的，同时在直系同源基因处存在广泛的调控变异。我们表明，SV并不会普遍重塑全局染色质图谱，而是通过依赖于具体背景的局部调控互作重构发挥作用。尽管表观基因组总体上较为稳定，SV仍可能通过染色质接触促进基因表达变化。组织特异性的染色质可及性表明，SV的效应依赖于发育背景。将关键春化基因处的染色质状态变异与SV整合分析，揭示了表观遗传因素对生长习性多样性的贡献。综上，这些结果为阐释作物基因组中结构变异的调控后果提供了一个框架。

结构变异（SV）在植物基因组中广泛存在并影响农艺性状，然而，对其调控作用的解释仍然充满挑战。在本研究中，我们结合了对20个大麦基因型的泛基因组范围DNA甲基化和染色质可及性的分析，并在其中10个基因型中辅以组蛋白修饰和染色质互作数据。对基因型特异性表观基因组的比较分析揭示了，在整个大麦泛基因组中，DNA甲基化图谱总体上是保守的，同时在直系同源基因处存在广泛的调控变异。我们表明，SV并不会广泛重塑全局染色质景观，而是通过依赖于具体背景的局部调控互作重连发挥作用。尽管这种表观基因组稳定性存在，SV仍可能通过染色质接触促成基因表达变化。组织特异性的染色质可及性表明，SV的效应依赖于发育背景。将关键春化基因处的染色质状态变异与SV整合分析，解释了表观遗传因素对生长习性多样性的贡献。总体而言，这些结果为解析作物基因组中结构变异的调控后果提供了一个框架。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.24.740502v1?rss=1

🏷️ 大麦泛基因组 结构变异 比较表观基因组学 DNA甲基化 染色质可及性 春化基因