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古菌和细菌经常在微生物群落中并存,因此至少在某些情况下必然会发生相互作用。此类跨域相互作用究竟主要表现为彼此忽视、合作,还是冲突,目前在根本上仍不清楚。探究古菌—细菌冲突的一个潜在切入点,是考察细菌用于杀伤其他细菌的某些分子武器是否也存在于古菌中,反之亦然。在此,为初步回答这一问题,我们对古菌基因组中的细菌素以及细菌基因组中的古菌素开展了系统发育基因组学调查。 我们发现,超过20%的已知细菌素——即细菌用以对抗其他细菌的蛋白质——在古菌中至少具有一个同源物。通常,这些古菌同源物与以单层膜细菌为靶标(且由其编码)的细菌素相关。基于功能关键残基、蛋白质结构以及对细菌素生物合成至关重要的辅助基因的保守性,我们重点指出,某些嗜热球菌属(Thermococcus)古菌中编码的 subtilosin A 同源物,是值得进一步实验研究的有前景候选对象。我们还表明,最初在 Natrinema 古菌中描述的 halocin C8 在细菌基因组中也相对常见,其中包括若干皮肤定植的葡萄球菌属(Staphylococcus)物种。 我们的结果表明,细菌素/古菌素以一定频率跨越域边界共享。尽管许多实例在系统发育上是孤立的——这使其功能重要性及其整合入宿主生理过程的程度受到质疑——但某些细菌素存在于多个相关基因组中,并嵌入更广泛的生物合成基因簇,而这些基因簇也见于最初的产生者,这提示古菌和细菌会周期性地在与其他微生物的冲突中使用相同的武器系统。对这些系统的进一步研究,或可阐明跨域冲突及不同环境中古菌—细菌相互作用的性质。
tobias.warnecke{at}bioch.ox.ac.uk
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摘要
古菌和细菌通常在微生物群落中并存,并且至少在某些情况下必须发生相互作用。这种跨域相互作用究竟主要表现为彼此忽视、合作,还是冲突,从根持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 发布。
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发布于 2026 年 7 月 28 日。 下载 PDF
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古菌中的细菌素与细菌中的古菌素
Romain Strock , Tobias Warnecke
bioRxiv 2026.07.27.741052; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.27.741052
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古菌中的细菌素与细菌中的古菌素
Romain Strock , Tobias Warnecke
bioRxiv 2026.07.27.741052; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.27.741052
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.27.741052v1?rss=1
🏷️ 古菌-细菌相互作用 细菌素 古菌素 系统发育基因组学 同源蛋白 微生物冲突
来源出处