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背景:可变剪接是心脏中蛋白质多样性的关键决定因素,它驱动心肌细胞出生后的功能成熟,并决定成熟收缩功能所需的离子通道和钙处理相关蛋白异构体;反过来,剪接程序失调已被认为与心肌病和心律失常有关。然而,调控心肌细胞钙处理的剪接调控因子目前在很大程度上仍不清楚。目的:我们在人诱导多能干细胞来源心肌细胞(hiPSC-CMs)中系统筛查了276个剪接因子基因,以鉴定钙处理的调控因子,并基于复合体水平富集结果以及Murphy等人于2021年的既往鉴定结果[1],选择核心U2 snRNP剪接体组分SF3B2进行深入后续研究。方法:在hiPSC-CMs中,采用384孔板钙瞬变成像进行了针对276个剪接因子基因的高通量siRNA筛查。随后对SF3B2敲低样本进行了深度bulk RNA-seq分析(每组n = 3),使用DESeq2进行差异基因表达分析,并使用rMATS进行可变剪接定量。采用带有表位标签的SF3B2构建体进行RNA免疫沉淀测序(RIP-seq),以鉴定SF3B2直接结合的mRNA靶标。结果:筛查鉴定出多个U2 snRNP组分,包括SF3A2、SF3B1和SF3B4,作为钙瞬变持续时间的调控因子。SF3B2此前已在该筛查中被鉴定为收缩性的调控因子[1],且在当前CTD75分析中,其复合体伙伴在显著性阈值以上的富集支持将其选为后续表征对象。SF3B2敲低导致2,683个差异表达基因(校正后p剪接因子 SF3B2 通过心脏离子通道基因的可变剪接调控心肌细胞钙处理 | bioRxiv
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剪接因子 SF3B2 通过心脏离子通道基因的可变剪接调控心肌细胞钙处理
Sean Murphy, 查看 ORCID 资料 Hanwen Wang, Nadine Zureick, Misato Koakutsu, David Suh, 查看 ORCID 资料 Dong Ik Lee, 查看 ORCID 资料 Chulan Kwon
doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.25.740735
Sean Murphy 约翰斯·霍普金斯大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 7 月 28 日。
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剪接因子 SF3B2 通过心脏离子通道基因的可变剪接调控心肌细胞钙处理
Sean Murphy, Hanwen Wang, Nadine Zureick, Misato Koakutsu, David Suh, Dong Ik Lee, Chulan Kwon
bioRxiv 2026.07.25.740735; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.25.740735
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剪接因子 SF3B2 通过心脏离子通道基因的可变剪接调控心肌细胞钙处理
Sean Murphy, Hanwen Wang, Nadine Zureick, Misato Koakutsu, David Suh, Dong Ik Lee, Chulan Kwon
bioRxiv 2026.07.25.740735; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.25.740735
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.25.740735v1?rss=1
🏷️ 可变剪接 SF3B2 心肌细胞 钙处理 离子通道基因 hiPSC-CMs