来自金色北极苔原土壤的两种新型杆状环状RNA呈现候选核酶样特征:一项计算机模拟表征

root 提交于 周二, 07/28/2026 - 20:47
近期对方尖碑样 RNA(obelisks)、新型丁型病毒样病毒(novel deltaviruses)以及其他类类病毒环状 RNA 的发现,极大地拓展了人们对自主性 RNA 元件已知多样性的认识。然而,寒冷陆地生态系统中这类分子的采样仍相对不足。 我们采用对 Tormentor 流水线进行基于结构的改造,从芬兰基尔皮斯耶尔维附近采集的奥罗北极苔原土壤冬季宏转录组中组装出两种推定的非编码杆状环状 RNA。基于序列的搜索未能为这两种 RNA 中任一种鉴定出有意义的同源序列。基于结构的分析显示,Rod 1 与类丁型病毒核酶具有亲缘性,Rod 2 与锤头状核酶具有亲缘性,并且通过整合进入既有协变模型证实了其结构兼容性。Rod 1 还在独立的高山宏转录组数据集中被检测到,而 Rod 2 除原始样本外未再被发现。综合来看,这些结果表明 Rod 1 是一种高度可信的类类病毒 RNA 候选分子,携带一种有待实验验证的推定类核酶结构基序;而 Rod 1 仍属于初步候选分子,尚需进一步确认。

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来自奥罗北极苔原土壤的两种新型杆状环状RNA展现出候选核酶样特征:一项计算机模拟表征研究

Noah Williams,

Garrett Wolfram,

Alice Zhang,

Maya Elena Tessler,

Geunhwa Jung

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.27.740603

Noah Williams 1 马萨诸塞大学阿默斯特分校; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可,不得重复使用。

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发表于 2026 年 7 月 27 日。

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Noah Williams,

Garrett Wolfram,

Alice Zhang,

Maya Elena Tessler,

Geunhwa Jung

bioRxiv 2026.07.27.740603; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.27.740603

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来自奥罗北极苔原土壤的两种新型杆状环状RNA展现出候选核酶样特征:一项计算机模拟表征研究

Noah Williams,

Garrett Wolfram,

Alice Zhang,

Maya Elena Tessler,

Geunhwa Jung

bioRxiv 2026.07.27.740603; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.27.740603


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.27.740603v1?rss=1

🏷️ 环状RNA 类类病毒 核酶 宏转录组 计算表征