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分子调查表明,RNA病毒在海洋中具有高度丰度和多样性,但由于仅有极少数此类病毒被成功培养,因此其中大多数病毒的宿主仍不清楚。在此,我们报告了5种从热带海水中分离得到的正义单链RNA(+ssRNA)病毒基因组,这些病毒可感染四鞭藻属(Tetraselmis,绿枝藻目 Chlorodendrales)绿藻。基于多个基因的系统发育分析表明,这些彼此近缘的病毒位于双顺反子病毒科(Dicistroviridae,小RNA病毒目 Picornavirales)之内,因此它们成为首批被证实可感染节肢动物以外生物的双顺反子病毒科成员。四鞭藻RNA病毒(TetRNAV01-05)的RNA依赖的RNA聚合酶基因和衣壳蛋白基因序列与其他来源于多种环境水样或水生无脊椎动物组织中的病毒序列聚类,并共同构成与三锥蝽病毒属(Triatovirus)病毒强有力支持的姐妹支系。TetRNAVs携带一种独特的基因间内部核糖体进入位点(IRES),提示其翻译策略不同于已报道的感染节肢动物的双顺反子病毒。我们的结果表明,许多尚未培养、此前因在无脊椎动物来源样品中被检出且其基因聚类于双顺反子病毒科内而被推定感染无脊椎动物的病毒,实际上可能是感染原生生物的病毒。
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摘要 分子调查表明,RNA 病毒在海洋中丰度高且多样性丰富,但由于仅有极少数此类病毒已被培养,其宿主对大多数这类病毒而言仍是未知的。在此,我们报告了从热带海水中分离得到的五种正义单链 RNA(+ssRNA)病毒的基因组,这些病毒可感染四鞭藻属(Tetraselmis,绿胞藻目 Chlorodendrales)绿藻。基于多个基因的系统发育分析将这些亲缘关系密切的病毒归入双顺反子病毒科(Dicistroviridae,Picornavirales 目),使其成为首批被证实感染节肢动物以外生物的、处于双顺反子病毒科范围内的病毒。四鞭藻 RNA 病毒(TetRNAV01-05)的 RNA 依赖的 RNA 聚合酶基因和衣壳基因序列与从多样环境水样或水生无脊椎动物组织中获得的其他序列聚为一类,并共同形成一个得到强有力支持的姐妹支,与 Triatovirus 属病毒分离。TetRNAVs 含有一种独特的基因间内部核糖体进入位点(IRES),提示其翻译策略不同于已在感染节肢动物的双顺反子病毒中描述的机制。我们的结果表明,许多未培养病毒之所以被推定为感染无脊椎动物,仅仅是因为它们是在无脊椎动物来源样持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可不得再次使用。
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发布于 2026 年 7 月 27 日。 下载 PDF
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Julie Thomy, Christopher R. Schvarcz, Kelsey A. Allen, Kyle F. Edwards, Grieg F. Steward
bioRxiv 2026.07.25.740690; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.25.740690
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Julie Thomy, Christopher R. Schvarcz, Kelsey A. Allen, Kyle F. Edwards, Grieg F. Steward
bioRxiv 2026.07.25.740690; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.25.740690
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🏷️ RNA病毒 原生生物病毒 双顺反子病毒科 海洋绿藻 系统发育分析 IRES