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量化仔鱼骨骼矿化表型因脊索的自然弯曲以及样本间在取向、染色和成像方面的差异而变得复杂。因此，许多研究依赖于诸如椎骨计数或总染色强度等汇总性指标。在此，我们提出SCAMP（Spinal Calcification & Mineralization Profiler，脊柱钙化与矿化分析器），这是一款开源、基于图形用户界面的Python工具，能够通过计算方法将茜素红S染色鱼类仔鱼弯曲的脊索拉直，并沿脊柱轴生成标准化的矿化谱。该方法减少了位置和形态变异，使得在无需编程专业知识的情况下，能够对实验队列内及队列间的钙化模式进行直接、定量的比较。 我们利用斑马鱼假黄瘤弹力纤维病模型（abcc6a^elu15/elu15）对SCAMP进行了验证，成功识别出基因型特异性的异位钙化在强度、范围和空间分布上的差异。进一步地，利用SCAMP，我们表明在培养介质中补充无机焦磷酸盐（PPi）可抑制脊索异位钙化，改变纯合突变体中矿化区域沿前后轴的分布，并促进生理性椎体部位的矿化。我们还表明，亚甲蓝作为鱼类培养液中常规使用的抗真菌添加剂，会降低基础钙化水平，其中在杂合对照组中观察到的效应最为显著。SCAMP可免费获取，并有潜力被改造应用于其他用于骨骼与矿化研究的鱼类物种。
2 机器感知研究实验室，HUN-REN计算机科学与控制研究所，匈牙利布达佩斯； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本作品依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 7 月 27 日。
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Dávid Czimer， Panna Kaluzsa， József Kövendi， Kamilla Luca Li， Blanka Kapusi， Viola Pomozi， Krisztina Fülöp， Balázs Nagy， Csaba Benedek， András Váradi， Máté Varga
bioRxiv 2026.07.25.740697； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.25.740697
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Dávid Czimer， Panna Kaluzsa， József Kövendi， Kamilla Luca Li， Blanka Kapusi， Viola Pomozi， Krisztina Fülöp， Balázs Nagy， Csaba Benedek， András Váradi， Máté Varga
bioRxiv 2026.07.25.740697； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.25.740697
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.25.740697v1?rss=1
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