- 2 次围观
理解生物多样性的核心在于对生物分类单元进行系统分类，而关于整合组学数据的理念尚未得到全面实施。这种数据驱动的方法旨在整合来自三个或更多尺度的系统发育数据，以增强物种界定的稳健性，同时揭示多样化与物种形成的进化驱动因素。 本研究以复杂叶状地钱类为参照对象，结合了DNA标记序列分析、利用生物成像测量的形态计量学分析，以及采用液相色谱-高分辨率质谱（UPLC/ESI-QTOF-MS）并结合串联质谱数据依赖采集（DDA-MS）的化学计量学分析，并通过树状图和数据挖掘评估性状变异。 比较分析显示，尽管系统树拓扑结构相似，但分类单元的位置存在分歧，这被归因于黄酮糖苷、花青素样色素和菲类化合物，它们源于进化辐射及对胁迫性生物气候条件的适应；而Riccia中独特的脂肪酰基则与物种形成的生态原因相关。特征性氨基酸基序证实了地钱类处于藻类与陆生植物之间的中间位置。通过对化学计量学标志物进行功能归属并映射至分类学体系，这种将组学整合入整合分类学的数据驱动方法，正在为植物系统学识别进化驱动因素并提出关于物种多样化和物种形成的新假说开辟机遇。
理解生物多样性的核心在于对生物分类单元进行系统分类，而关于整合组学数据的理念尚未得到全面实施。这种数据驱动的方法旨在整合来自三个或更多尺度的系统发育数据，以增强物种界定的稳健性，同时揭示多样化与物种形成的进化驱动因素。
本研究以复杂叶状地钱类植物为参照对象，结合DNA标记序列分析、利用生物成像测量的形态计量学分析，以及采用液相色谱-高分辨率质谱（UPLC/ESI-QTOF-MS）并结合串联质谱数据依赖采集（DDA-MS）的化学计量学分析，同时借助树状图和数据挖掘评估性状变异。比较分析显示，尽管系统树拓扑结构相似，但分类单元的位置存在差异，这归因于黄酮苷、花青素类化合物和菲类化合物，它们源于进化辐射及对胁迫性生物气候条件的适应；而Riccia中独特的脂肪酰基则与物种形成的生态原因相关。特征性氨基酸基序证实了苔类植物在藻类与陆生植物之间的中介位置。通过对化学计量学标志物进行功能归属并将其映射到分类学中，这种将组学整合入综合分类学的数据驱动方法，正为植物系统学识别进化驱动因素并提出关于物种多样化与物种形成的新假说开辟机会。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.23.740253v1?rss=1
🏷️ 整合分类学 系统发育 DNA标记 化学计量学 地钱类 植物系统学
来源出处