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视网膜母细胞瘤(retinoblastoma,RB)是最常见的儿童眼内恶性肿瘤,其发生由RB1肿瘤抑制基因双等位失活所启动。尽管LINE-1(L1)逆转座子激活已被证实与多种成人癌症中的基因组不稳定性和肿瘤演化相关,但其在儿童恶性肿瘤中的作用仍知之甚少。在本研究中,我们通过整合转录组学、位点特异性分析和免疫组织化学方法,研究了来自印度儿童队列的视网膜母细胞瘤样本中的L1表达。 转录组分析显示,与对照视网膜组织相比,RB肿瘤中L1表达升高,并通过肿瘤切片中的ORF1p免疫染色得到了验证。位点特异性分析鉴定出一部分转录活跃的L1位点,提示年轻L1元件发生了选择性激活。我们还观察到与细胞增殖、染色质调控和致癌信号传导相关基因的表达发生改变,包括MYCN、MDM2、E2F3、SOX4和CREBBP。 我们的研究结果表明,先前较少被关注的L1激活是与视网膜母细胞瘤相关的一种分子特征,并提示转座子沉默机制的破坏伴随着RB的转录图谱变化。尽管仍需在更大规模的患者队列中进行验证,但本研究为探索L1活性作为视网膜母细胞瘤潜在分子标志物及未来治疗脆弱性提供了基础。
视网膜母细胞瘤(retinoblastoma, RB)是最常见的儿童眼内恶性肿瘤,其发生由RB1肿瘤抑制基因双等位失活所启动。尽管LINE-1(L1)逆转座子的激活已被证实与多种成人癌症中的基因组不稳定性和肿瘤演化相关,但其对儿童恶性肿瘤的贡献仍知之甚少。在本研究中,我们通过整合转录组学、位点特异性分析和免疫组织化学,对印度儿童队列的视网膜母细胞瘤样本中的L1表达进行了研究。
转录组谱分析显示,与对照视网膜组织相比,RB肿瘤中L1表达升高;这一结果通过肿瘤切片中的ORF1p免疫染色得到验证。位点特异性分析鉴定出一部分具有转录活性的L1位点,提示年轻L1元件发生了选择性激活。我们还观察到与细胞增殖、染色质调控和致癌信号传导相关基因的表达发生改变,包括MYCN、MDM2、E2F3、SOX4和CREBBP。
我们的研究结果表明,此前研究较少涉及的L1激活是与视网膜母细胞瘤相关的一种分子特征,并提示转座子沉默的破坏伴随着RB的转录图谱。尽管仍需在更大规模的患者队列中进行验证,但本研究为探索L1活性作为视网膜母细胞瘤潜在分子标志物及未来治疗脆弱性的基础提供了依据。
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.25.740688v1?rss=1
🏷️ 视网膜母细胞瘤 LINE-1逆转座子 表观遗传重塑 转录组分析 基因组不稳定性
来源出处
视网膜母细胞瘤中LINE-1转座子的去抑制及表观遗传重塑
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.25.740688v1?rss=1