基于DNA条形码的配对姐妹细胞分析揭示了造血干细胞的分裂偏好

root 提交于 周六, 07/25/2026 - 08:47
造血干细胞(HSC)通过干细胞-干细胞分裂维持其细胞池,并通过干细胞-祖细胞或祖细胞-祖细胞分裂产生成熟血细胞。配对子细胞(PDC)分析结合单细胞移植,是比较两个HSC子代细胞谱系输出的一种强有力方法。然而,单细胞移植限制了对子代细胞配对的大规模分析,因为每个受体只能移植一个细胞。在此,我们开发了一种基于DNA条形码的PDC分析方法,以克服这一限制,从而能够同时分析来源于单个HSC分裂的476对子代细胞,并揭示子代细胞命运具有协调性,且HSC分裂模式更倾向于干细胞-干细胞分裂和祖细胞-祖细胞分裂,而非干细胞-祖细胞分裂。这些发现表明,HSC命运结局趋向于对称性分裂结局。将单细胞RNA测序与DNA条形码技术整合后,我们揭示了HSC状态的连续谱系:从平衡型HSC到髓系偏向型HSC,最终到低输出HSC亚群;在这一过程中,相对于干细胞扩增而言,成熟血细胞产量逐步降低——这一特征可作为干细胞-干细胞分裂偏倚的替代指标——并表现出转录因子活性和信号通路活性的显著差异。总体而言,我们的分析揭示了HSC分裂的特征性模式,并将干细胞维持与独特的分子特征联系起来。

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基于 DNA 条形码的配对姐妹细胞分析揭示造血干细胞的分裂偏好

Tsuyoshi Fukushima, Akira Nishiyama, Shuhei Koide, Tomoya Isobe, Tomohiro Yabushita, Shuhei Asada, Susumu Goyama, Atsushi Iwama, Satoshi Yamazaki, Tomohiko Tamura, Toshio Kitamura, Toshio Suda, Yosuke Tanaka

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.24.739718

Tsuyoshi Fukushima 1 东京大学医科学研究所细胞治疗分部,日持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开提供。

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发表于 2026 年 7 月 24 日。

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Tsuyoshi Fukushima, Akira Nishiyama, Shuhei Koide, Tomoya Isobe, Tomohiro Yabushita, Shuhei Asada, Susumu Goyama, Atsushi Iwama, Satoshi Yamazaki, Tomohiko Tamura, Toshio Kitamura, Toshio Suda, Yosuke Tanaka

bioRxiv 2026.07.24.739718; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.24.739718

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Tsuyoshi Fukushima, Akira Nishiyama, Shuhei Koide, Tomoya Isobe, Tomohiro Yabushita, Shuhei Asada, Susumu Goyama, Atsushi Iwama, Satoshi Yamazaki, Tomohiko Tamura, Toshio Kitamura, Toshio Suda, Yosuke Tanaka

bioRxiv 2026.07.24.739718; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.24.739718


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.24.739718v1?rss=1

🏷️ DNA条形码 造血干细胞 对称性分裂 单细胞RNA测序 细胞命运决定