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炎症性肠病（IBD）是一组慢性、复发性的免疫介导性疾病，其中 NF-{kappa}B 和 STAT3 信号通路在其发病机制中发挥核心作用。尽管肠道微生物组失衡在 IBD 中已有充分描述，但其功能性后果，尤其是微生物免疫调节功能（MIF），仍缺乏明确界定。在本研究中，我们将功能实验与宏基因组学分析相结合，以表征 IBD 中由微生物组驱动的免疫调节作用。采用 NF-{kappa}B 和 STAT3 报告系统评估非 IBD 对照者和 IBD 患者的粪便水样，同时对 2,820 株细菌分离株（每位受试者 94 株）进行高通量筛选。尽管整体微生物组成差异极小，溃疡性结肠炎（UC）和克罗恩病（CD）患者的粪便水样在基础条件和 TNF 刺激条件下均显著增强了 NF-{kappa}B 活性。与 UC（5.64%）和 CD（2.45%）相比，非 IBD 对照者携带更高比例的抑制性细菌分离株（21.52%）；而激活性分离株则在 IBD 中富集（UC：34.47%；CD：39.36%；非 IBD：5.35%）。对于 IL-23 介导的 STAT3 激活也观察到类似趋势。通过整合宏基因组学与通路水平分析，我们鉴定出 24 条与炎症信号传导和粪便脂质运载蛋白-2相关的 KEGG 通路，以及涉及氨基酸、碳水化合物、脂质、辅因子和核苷酸代谢的通路。这些发现表明，IBD 微生物组在功能上被重编程为促炎状态，且这种改变独立于组成变化。界定患者特异性的 MIF 谱，可能为 IBD 中基于微生物组的精准治疗策略提供框架。
微生物免疫调节功能在炎症性肠病中发生改变，且独立于微生物组成 | bioRxiv
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微生物免疫调节功能在炎症性肠病中发生改变，且独立于微生物组成
Rabina Giri， Jing Jie Teh， Fan Zhang， Hayley Reed， Georgina L Hold， Paraic O Cuiv， Mark Morrison， Jakob Begun
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.22.740186
Rabina Giri 1 Mater 研究所——昆士兰大学，转化研究所，Woolloongabba，昆士兰州，4102；
通讯作者： rabina.giri{at}mater.uq.edu.au
Jing Jie Teh 2 Frazer 研究所，昆士兰大学，Woolloongabba，昆士兰州，4102；
Fan Zhang 3 新南威尔士大学医学院与健康学院微生物组研究中心，悉尼，澳大利亚
Hayley Reed 1 Mater 研究所——昆士兰大学，转化研究所，Woolloongabba，昆士兰州，4102；
Georgina L Hold 3 新南威尔士大学医学院与健康学院微生物组研究中心，悉尼，澳大利亚
Paraic O Cuiv 2 Frazer 研究所，昆士兰大学，Woolloongabba，昆士兰州，4102；
Mark Morrison 2 Frazer 研究所，昆士兰大学，Woolloongabba，昆士兰州，4102；
Jakob Begun 1 Mater 研究所——昆士兰大学，转化研究所，Woolloongabba，昆士兰州，4102；
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炎症性肠病（IBD）是一类慢性、复发性的免疫介导性疾病，其中 NF-κB 和 STAT3 信号通路在发病机制中发挥核心作用。尽管肠道微生物组失调在 IBD 中已有充分描述，但其功能性后果，尤其是微生物免疫调节功能（microbial immunomodulatory function, MIF），仍缺乏明确界定。在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
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发布于 2026 年 7 月 24 日。
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Rabina Giri， Jing Jie Teh， Fan Zhang， Hayley Reed， Georgina L Hold， Paraic O Cuiv， Mark Morrison， Jakob Begun
bioRxiv 2026.07.22.740186； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.22.740186
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微生物免疫调节功能在炎症性肠病中发生改变，且独立于微生物组成
Rabina Giri， Jing Jie Teh， Fan Zhang， Hayley Reed， Georgina L Hold， Paraic O Cuiv， Mark Morrison， Jakob Begun
bioRxiv 2026.07.22.740186； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.22.740186
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.22.740186v1?rss=1
🏷️ 炎症性肠病 肠道微生物组 免疫调节功能 NF-κB/STAT3信号 宏基因组学 促炎重编程