综合生物信息学分析揭示与子痫前期相关的候选枢纽基因及调控网络

root 提交于 周六, 07/25/2026 - 12:47
子痫前期(PE)是一种严重的妊娠相关高血压性疾病,也是导致孕产妇和围产期发病率及死亡率升高的重要因素。PE 发病机制尚未完全阐明。本文旨在利用胎盘转录组数据集的生物信息学分析,探索与 PE 相关的候选生物标志物及其调控机制。我们从 GEO 数据库下载了胎盘转录组数据集 GSE203507 和 GSE148241,并分析了 PE 样本与对照样本之间的差异表达基因(DEGs)。我们进行了基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、疾病本体(DO)以及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,以表征这些 DEGs 的潜在功能、疾病关联及其相互作用网络。我们还利用两个独立的胎盘转录组数据集 GSE143966 和 GSE114691,对候选枢纽基因的 mRNA 表达模式进行了验证。在发现性分析中,我们鉴定出 263 个 DEGs,并进一步获得了 150 个重叠 DEGs,其中包括 80 个上调基因和 70 个下调基因,用于后续分析。随后,我们利用 Metascape 软件(v3.5.20260201)鉴定出 8 个候选枢纽基因:OPRK1、OXGR1、HCAR3、CCR5、HCAR2、CXCL1、FPR3 和 SSTR1。在验证阶段,大多数候选枢纽基因在 GSE114691 和 GSE143966 中表现出总体一致的 mRNA 表达趋势,而 FPR3 在不同数据集间的一致性较弱。这些发现为进一步开展实验和临床验证提供了与 PE 相关的候选基因及调控通路。

子痫前期(preeclampsia,PE)是一种严重的妊娠相关高血压性疾病,也是导致孕产妇和围产儿发病率及死亡率升高的主要原因之一。PE 发病机制目前尚未明晰。本文旨在通过对胎盘转录组数据集进行生物信息学分析,探索与 PE 相关的候选生物标志物及其调控机制。我们从 GEO 数据库下载了胎盘转录组数据集 GSE203507 和 GSE148241,并研究了 PE 样本与对照样本之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。我们进行了基因本体(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)、疾病本体(Disease Ontology,DO)以及蛋白质—蛋白质相互作用(protein–protein interaction,PPI)分析,以表征这些 DEGs 的潜在功能、疾病关联及其相互作用网络。我们还利用两个独立的胎盘转录组数据集 GSE143966 和 GSE114691,对候选枢纽基因的 mRNA 表达模式进行了验证。在发现分析中,我们鉴定出 263 个 DEGs,并进一步获得了 150 个重叠 DEGs,其中包括 80 个上调基因和 70 个下调基因,用于后续分析。随后,我们利用 Metascape 软件(v3.5.20260201)鉴定出 8 个候选枢纽基因:OPRK1、OXGR1、HCAR3、CCR5、HCAR2、CXCL1、FPR3 和 SSTR1。在验证阶段,大多数候选枢纽基因在 GSE114691 和 GSE143966 中表现出总体一致的 mRNA 表达趋势,而 FPR3 在不同数据集之间的一致性较弱。这些发现为进一步开展实验和临床验证提供了与 PE 相关的候选基因和调控通路。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.20.739688v1?rss=1

🏷️ 子痫前期 胎盘转录组 差异表达基因 枢纽基因 PPI网络 生物标志物