基因型与环境在河口刺胞动物病毒组和微生物组动态中的交互作用

root 提交于 周六, 07/25/2026 - 04:47
河口生态系统孕育着丰富多样的微生物,从而为塑造宿主生理的动物—微生物相互作用提供了机会。海葵 Nematostella vectensis 分布于北美东海岸,从新斯科舍延伸至佛罗里达;既往研究表明,来自不同地区的海葵携带着不同的微生物群落。尽管标准实验室种群的病毒组已被表征,但不同种群间病毒组的变异在很大程度上仍不清楚。为填补这一空白,我们开展了一项中宇宙实验,选用 6 个 N. vectensis 种群,以检验地理来源是否会影响其相关病毒和细菌的多样性及功能潜力。我们在中宇宙暴露前以及 14 天后对个体进行采样,对其病毒组、微生物组和宿主转录组进行测序。我们还从一个自然种群中采集了海葵,用于与实验动物进行比较。病毒组和微生物组分析均显示,14 天后分类多样性和功能多样性均有所增加,且增幅在低纬度种群中最为显著。值得注意的是,实验海葵的群落组成确实趋同于自然种群;然而,种群特异性的病毒与微生物相互作用仍然持续存在。差异基因表达分析表明,宿主总体响应较为温和,而 WGCNA 则识别出清晰的南北向表达模式。综上,这些发现表明,沿纬度梯度分布的不同地点来源的 N. vectensis 基因型维持着彼此不同的病毒和微生物关联,突显了具有地理结构性的宿主—微生物—病毒关系。

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基因型与环境对河口刺胞动物病毒组和微生物组动态的交互影响

Sydney J. Birch Yehu Moran Adam M. Reitzel

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.23.740364

Sydney J. Birch 1 北卡罗来纳大学夏洛特分校; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 该作品依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议提供。

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发表于 2026 年 7 月 24 日。

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基因型与环境对河口刺胞动物病毒组和微生物组动态的交互影响

Sydney J. Birch, Yehu Moran, Adam M. Reitzel

bioRxiv 2026.07.23.740364; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.23.740364

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Sydney J. Birch, Yehu Moran, Adam M. Reitzel

bioRxiv 2026.07.23.740364; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.23.740364


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.23.740364v1?rss=1

🏷️ 宿主-微生物互作 病毒组 微生物组 地理种群分化 河口生态系统 转录组分析