代谢组全基因组关联研究揭示了大豆中黄酮代谢的分层及上位性遗传调控

root 提交于 周六, 07/25/2026 - 00:47
代谢表型通常受复杂遗传结构支配,其中既包括加性效应,也包括非加性效应。然而,上位性互作在植物代谢通路水平调控中所作贡献的程度仍不清楚。 在本研究中,我们利用在多种环境条件下栽培的200份大豆材料的代谢组学和基因组学数据,研究了黄酮相关代谢物的遗传结构。广义遗传力估计表明,许多代谢物受到较强的遗传控制,尤其是黄酮相关代谢物。基于主成分分析的全代谢组全基因组关联研究鉴定出4个与黄酮代谢变异相关的主要位点,其中包括一个对应于黄酮3'-羟化酶的位点。基于多位点遗传背景的条件分析表明,下游位点的效应高度依赖于上游基因型。特别是,单核苷酸多态性的效应往往仅能在由主要黄酮3'-羟化酶位点定义的特定等位基因背景中被检测到,这与位点间存在强烈上位性互作的结果一致。贝叶斯网络分析进一步支持了一种层级性遗传结构,该结构与黄酮生物合成通路中上游位点对下游位点的调控相一致。 这些结果表明,高遗传力的代谢表型可由少数几个同时表现出加性效应和依赖背景的非加性效应的位点所控制。我们的研究结果表明,大豆中通路水平的代谢多样性是通过涉及有限数量关键位点的层级性和上位性遗传控制产生的。

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代谢组全基因组关联研究揭示大豆中黄酮代谢的层级性与上位性遗传控制

Taisei Hatta, Kosuke Hamazaki, Yushiro Fuji, Yusuke Toda, Yasunori Ichihashi, Yoshihiro Ohmori, Yuji Yamasaki, Hirokazu Takahashi, Hideki Takanashi, Mai Tsuda, Hisashi Tsujimoto, Akito Kaga, Mikio Nakazono, Toru Fujiwara, Masami Yokota Hirai, Hiroyoshi Iwata

bioRxiv 2026.07.23.739694; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.23.739694

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代谢组全基因组关联研究揭示大豆中黄酮代谢的层级性与上位性遗传控制

Taisei Hatta, Kosuke Hamazaki, Yushiro Fuji, Yusuke Toda, Yasunori Ichihashi, Yoshihiro Ohmori, Yuji Yamasaki, Hirokazu Takahashi, Hideki Takanashi, Mai Tsuda, Hisashi Tsujimoto, Akito Kaga, Mikio Nakazono, Toru Fujiwara, Masami Yokota Hirai, Hiroyoshi Iwata

bioRxiv 2026.07.23.739694; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.23.739694


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.23.739694v1?rss=1

🏷️ 大豆 代谢组GWAS 黄酮代谢 上位性互作 层级遗传调控