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欧亚大陆西部的新石器时代经历了重大的扩散事件，其中包括家畜向欧洲的迁移。这些家养动物的迁移很可能伴随着奠基者效应，从根本上重塑了它们的遗传格局。一个广为人知的例子是地中海扩散，其被假设为通过海上快速转运、以少量奠基畜群完成的过程，然而这种过程对家畜自身所造成的遗传后果仍然知之甚少。为探究这一问题，我们生成了来自拉德拉加和科瓦-德尔阿韦利亚内尔的12个绵羊和山羊古基因组，并将其与其他新石器时代地中海遗存组合进行联合分析，其中包括另外4个新的基因组。 我们观察到，与其他欧洲古代群体及西亚西南部群体相比，伊比利亚绵羊和山羊群体表现出显著更低的遗传多样性以及更高的纯合区段（ROH）水平。我们将山羊群体瓶颈的强度定量估计为约205的有效群体大小（Ne），凸显了这一奠基事件的严重程度。我们进一步识别出物种特异性的人口动态轨迹：山羊经历了严重且持续时间较长的瓶颈，这很可能是由西地中海区域内部的隔离、集约化利用策略以及较小的初始奠基畜群共同驱动的；而绵羊则可能在该区域内更频繁地被交换。最后，基于同祖传递（IBD）的分析表明，地中海沿岸存在与沿岸航行模型相一致的连通性。这表明，海上通道促进了最初的快速扩散，但并未维持来自西亚西南部的持续性家畜转移，从而塑造了伊比利亚家畜畜群的遗传基础。
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西欧亚的新石器时代经历了重大的扩散事件，其中包括家畜向欧洲的迁移。这些家养动物的迁移很可能伴随着奠基者效应，从根本上重塑了它们的遗传格局。一个广为人知的例子是地中海扩散，研究者推测其涉及通过海路进行的快速迁移以及规模较小的奠基畜群，但其对家畜自身所产生的遗传后果仍知之甚少。为研究这一问题，我们构建了来自 La Draga 和 Cova de l'Avellaner 的 12 个绵羊和山羊古基因组，并将其与其他新石器时代地中海遗存进行联合分析，其中包括另外 4 个新增基因组。我们观察到，与其他欧洲古代群体和西亚西南部群体相比，伊比利亚绵羊和山羊种群表现出显著更低的遗传多样性和更高的纯合片段（ROH）水平。我们将山羊种群瓶颈的规模量化为约 205 的有效群体大小（Ne），凸显了这一奠基事件的严重程度。我们进一步识别出物种特异性的人口动态轨迹：山羊经历了严重且持久的瓶颈，这可能是由西地中海区域内的相对隔离、集约化利用策略以及较小的初始奠基畜群共同驱动的；而绵羊则很可能在该地区内更频繁地被交换。最后，遗传同祖片段（IBD）分析表明，地中海沿岸存在与沿岸航行模型相一致的连通性。这表明海上通道促进了最初的快速扩散，但并未支持来自西亚西南部的家畜持续转移，从而塑造了伊比利亚家畜畜群的遗传基础。
利益冲突声明
已声明资助信息
Taighde Éireann - Research Ireland， https://ror.org/010t7sr36 ，21/PATH-S/9515(T)
欧洲研究委员会， https://ror.org/0472cxd90 ，885729-AncestralWeave
ICREA Academia 项目（MS） ，PID2020-115715GB-I00 ，PID2023-152137NB-I00（PI: MS）
版权
本预印本的。
本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
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发布于 2026 年 7 月 23 日。
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《地中海扩散对新石器时代绵羊和山羊造成了瓶颈效应》
Áine Halpin ， Jolijn AM Erven ， Roger Alcàntra ， Conor Rossi ， Andrew J Hare ， Valeria Mattiangeli ， Simon Stoddart ， Jarosław Wilczyński ， Àngel Bosch LLoret ， Raquel Piqué Huerta ， Antoni Palomo Pérez ， Josep Tarrús Galter ， Xavier Terradas Batlle ， Maria Saña-Seguí ， Daniel G Bradley ， Kevin G Daly
bioRxiv
2026.07.21.739115； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739115
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《地中海扩散对新石器时代绵羊和山羊造成了瓶颈效应》
Áine Halpin ， Jolijn AM Erven ， Roger Alcàntra ， Conor Rossi ， Andrew J Hare ， Valeria Mattiangeli ， Simon Stoddart ， Jarosław Wilczyński ， Àngel Bosch LLoret ， Raquel Piqué Huerta ， Antoni Palomo Pérez ， Josep Tarrús Galter ， Xavier Terradas Batlle ， Maria Saña-Seguí ， Daniel G Bradley ， Kevin G Daly
bioRxiv
2026.07.21.739115； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739115
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.21.739115v1?rss=1
🏷️ 古基因组 家畜驯化 种群瓶颈 遗传多样性 地中海扩散 新石器时代