Uni-TINT:利用高分辨率、跨疾病和跨组织的单细胞转录组图谱统一T细胞与先天淋巴样细胞分类学

root 提交于 周五, 07/24/2026 - 10:47
T细胞和先天性淋巴样细胞(ILCs)在不同组织和疾病中表现出广泛的表型多样性,然而,不一致的注释限制了跨研究比较和生物学解释。我们提出了Uni-TINT,一个整合的泛疾病、泛组织图谱,包含来自1,869个样本的346万个细胞,涵盖194项研究、166种疾病亚型和66种组织类型。通过系统化、分层级的人工注释,Uni-TINT建立了一个统一且具有情境感知能力的T细胞和ILC群体分类体系,解析了常规与非常规T细胞、自然杀伤(NK)细胞、辅助性ILCs、胸腺细胞和造血祖细胞中的207种细胞亚型和状态。我们鉴定出一种具有免疫抑制作用的肿瘤相关CD4调节性T细胞群体,并通过空间转录组学对其进行了验证。其他被表征的罕见及非常规群体还包括CD8调节性T细胞、不变型NKT细胞和记忆样NK细胞。T细胞受体测序整合分析提示,{gamma}{delta} T细胞共受体表达与TRDV基因使用之间存在功能相关性。最后,对健康和疾病状态下未成熟细胞的比较分析鉴定出一小群携带染色体异常、并在混合表型急性白血病中富集的恶性造血干细胞。总体而言,Uni-TINT为健康与疾病状态下的免疫注释和生物学发现提供了统一的参考框架。

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Uni-TINT:通过高分辨率、跨疾病和跨组织的单细胞转录组图谱统一 T 细胞与先天性淋巴样细胞分类学

Samuel W.J. Chuah

Mengwei Li

Kok Siong Ang

Nicholas R.J. Gascoigne

Jinmiao Chen

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.20.739448

Samuel W.J. Chuah

1 生物医学数据科学中心与癌症及干细胞生物学项目,新加坡杜克-新加坡国立大学医学院;

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发表于 2026 年 7 月 23 日。

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Samuel W.J. Chuah

Mengwei Li

Kok Siong Ang

Nicholas R.J. Gascoigne

Jinmiao Chen

bioRxiv

2026.07.20.739448;

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.20.739448

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Uni-TINT:通过高分辨率、跨疾病和跨组织的单细胞转录组图谱统一 T 细胞与先天性淋巴样细胞分类学

Samuel W.J. Chuah

Mengwei Li

Kok Siong Ang

Nicholas R.J. Gascoigne

Jinmiao Chen

bioRxiv

2026.07.20.739448;

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.20.739448


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.20.739448v1?rss=1

🏷️ 单细胞转录组 T细胞 先天淋巴样细胞 免疫图谱 空间转录组学 细胞分类学