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背景:Partner and Localizer of BRCA2(PALB2)是一个关键的肿瘤抑制基因,通过与BRCA1和BRCA2相互作用参与同源重组介导的DNA修复。PALB2的种系变异已被证实与遗传性乳腺癌风险相关;然而,其在乳腺癌进展和预后中的更广泛分子作用仍有待进一步研究。 方法:利用公开可用的数据库和生物信息学平台,对PALB2进行了全面的计算机模拟分析。采用GEPIA2评估PALB2在乳腺癌中的差异表达。通过Kaplan-Meier分析评估其对总生存期(OS)和无病生存期(DFS)的预后意义。使用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。采用g:Profiler对PALB2相关基因进行功能富集分析。利用cBioPortal并结合TCGA乳腺癌队列数据,对乳腺癌中PALB2的突变谱进行分析。 结果:与正常乳腺组织相比,PALB2在乳腺肿瘤组织中的表达升高。生存分析显示,PALB2表达与总生存期(HR = 0.88,p = 0.44)或无病生存期(HR = 0.74,p = 0.11)均无统计学显著相关性。蛋白质相互作用分析显示,PALB2与包括BRCA1、BRCA2、RAD51、RAD51C、FANCD2和BRIP1在内的主要DNA修复蛋白存在较强相互作用。功能富集分析显示显著通路富集较为有限,仅观察到边缘性的转录因子基序富集。突变分析表明,PALB2存在多样化的基因组改变,包括错义突变、截短突变、拷贝数增加和浅缺失。 结论:研究结果通过PALB2的高表达及其在DNA修复通路中的强连接性,支持了其在乳腺癌中的生物学相关性。然而,单独的PALB2表达似乎并不能作为独立的预后指标。未来仍需整合基因组学、转录组学和临床参数开展进一步研究,以阐明其在乳腺癌进展及治疗反应中的作用。 关键词:PALB2;乳腺癌;生物信息学;基因表达分析;蛋白质-蛋白质相互作用;生存分析;突变谱分析;同源重组;TCGA;GEPIA2
PALB2 的综合生物信息学分析揭示其在乳腺癌中的表达模式、分子相互作用及预后意义 | bioRxiv
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PALB2 的综合生物信息学分析揭示其在乳腺癌中的表达模式、分子相互作用及预后意义
Arifa Jahan Bithi , Mahatab Hasan Rahat
doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739427
Arifa Jahan Bithi East West University 遗传工程与生物技术系 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在限制。任何人均可出于任何目的合法分享、再利用、混编或改编本材料,而无需注明原始作者。
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发表于 2026 年 7 月 23 日。
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Arifa Jahan Bithi , Mahatab Hasan Rahat
bioRxiv 2026.07.19.739427; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739427
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Arifa Jahan Bithi , Mahatab Hasan Rahat
bioRxiv 2026.07.19.739427; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739427
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.19.739427v1?rss=1
🏷️ PALB2 乳腺癌 DNA修复 蛋白互作网络 生存分析 突变谱
来源出处
PALB2的综合生物信息学分析揭示其在乳腺癌中的表达模式、分子相互作用及预后意义
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.19.739427v1?rss=1