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环状RNA（circRNA）广泛存在于真核生物中；circRNA表达失调与包括肺癌在内的多种疾病相关。与来源于外显子-内含子边界的经典circRNA不同，起源于外显子内部、内含子区域和基因间区的非经典circRNA通常被视为转录噪声或技术伪影而遭忽视。为探索circRNA的多样性并认识其功能，我们开发了一种无需依赖基因组注释即可同时鉴定经典和非经典circRNA的算法，从而能够识别所有类型的circRNA，并适用于新测序或注释不完善的物种。在肺癌细胞中的研究结果显示，非经典circRNA占circRNA总群体的三分之二以上，且其表达丰度高于经典circRNA；同时，外显子数量更少且长度更短的基因是非经典circRNA及circRNA异构体产生的热点。进一步分析表明，许多非经典circRNA确为细胞内转录产生的内源性circRNA，而非实验伪影；它们可能被翻译为蛋白质或多肽，并且在物种间具有保守性。此外，我们利用多种生物测定方法在NCI-H23细胞中验证了65种非经典circRNA，并证明外显子来源和基因间区来源的非经典circRNA均会影响细胞活力。对肺癌患者肿瘤组织及癌旁组织中的circRNA谱分析显示，circRNA具有组织特异性表达特征，并且来源于参与癌症相关通路的对应基因的经典与非经典circRNA存在差异表达，这表明它们具有潜在的临床相关性。本研究证实了非经典circRNA的真实性，并首次提供了非经典circRNA影响癌细胞表型的实验依据。这些发现拓展了我们对circRNA生物学的理解，凸显了其广泛的基因组分布、多样化的功能及潜在的临床意义。
3 香港大学临床医学院深圳医院临床肿瘤学系，香港大学临床医学院，中国香港； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本作品依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 提供。
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发表于 2026 年 7 月 23 日。 下载 PDF 补充材料 数据/代码 电子邮件
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非经典环状 RNA 及其潜在功能 Kang Li ， Weixu Wang ， Abebe Edao Negesso ， Jing Deng ， Haoning Qin ， Jiahao Jiang ， Ke Ma ， Jie Zhang ， Ping Wei ， Dawei Li ， Feng-Ming Spring Kong ， William C. Cho ， Shulan Qiu ， weixong zhang bioRxiv 2026.07.23.740256； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.23.740256
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非经典环状 RNA 及其潜在功能 Kang Li ， Weixu Wang ， Abebe Edao Negesso ， Jing Deng ， Haoning Qin ， Jiahao Jiang ， Ke Ma ， Jie Zhang ， Ping Wei ， Dawei Li ， Feng-Ming Spring Kong ， William C. Cho ， Shulan Qiu ， weixong zhang bioRxiv 2026.07.23.740256； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.23.740256
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🏷️ 环状RNA 非经典circRNA 肺癌 转录组算法 细胞活力 组织特异性表达