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受调控的角质形成细胞分化是形成复层表皮及其功能性屏障所必需的。理解驱动角质形成细胞分化的遗传因素，对于认识多种皮肤疾病至关重要。Perturb-seq 是一种单细胞 CRISPR 筛选技术，用于测量扰动所引发的转录组响应。迄今为止，Perturb-seq 实验主要集中于二维细胞培养模型，而这类模型缺乏皮肤发育的关键特征——生理性的桥粒形成和屏障功能。在此，我们在一种能够重现生理相关分化程序的表皮类器官模型中应用 Perturb-seq。我们证明，我们施加的扰动显著影响了多种分化程序，并揭示了非经典 NF-{kappa}B 信号通路在角质形成细胞晚期分化中的双向功能。
Perturb-seq解析表皮类器官中的生理程序及非经典NF-κB信号传导的双向调控 | bioRxiv
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Perturb-seq解析表皮类器官中的生理程序及非经典NF-κB信号传导的双向调控
查看 ORCID 个人主页 Galen Squiers， 查看 ORCID 个人主页 Benjamin A Nanes， 查看 ORCID 个人主页 Maggie Balas， 查看 ORCID 个人主页 Joshua J Lingo， Lei Wang， Huan Zhou， Sabahat Munawar， Mpathi Nzima， 查看 ORCID 个人主页 Gary C Hon， 查看 ORCID 个人主页 Jason Klein
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.22.739901
Galen Squiers 1 科罗拉多大学安舒茨医学园区； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者 Galen Squiers 的 ORCID 记录 通讯作者： galen.squiers{at}cuanschutz.edu
Benjamin A Nanes 2 得克萨斯大学西南医学中心 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者 Benjamin A Nanes 的 ORCID 记录
Maggie Balas 1 科罗拉多大学安舒茨医学园区； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者 Maggie Balas 的 ORCID 记录
Joshua J Lingo 1 科罗拉多大学安舒茨医学园区； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者 Joshua J Lingo 的 ORCID 记录
Lei Wang 2 得克萨斯大学西南医学中心 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Huan Zhou 2 得克萨斯大学西南医学中心 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Sabahat Munawar 2 得克萨斯大学西南医学中心 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Mpathi Nzima 2 得克萨斯大学西南医学中心 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Gary C Hon 2 得克萨斯大学西南医学中心 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者 Gary C Hon 的 ORCID 记录
Jason Klein 1 科罗拉多大学安舒茨医学园区； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者 Jason Klein 的 ORCID 记录
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摘要
受调控的角质形成细胞分化是形成复层表皮及其功能性屏障所必需的。理解角质形成细胞分化的遗传驱动因素，对于认识多种皮肤疾病至关重要。Perturb-seq 是一种单细胞 CRISPR 筛选方法，用于测量扰动引起的转录组响应。迄今为止，Perturb-seq 实验主要集中于二维细胞培养模型，而这类模型缺乏皮肤发育的标志性特征——生理性的桥粒形成和屏障功能。在本研究中，我们在一种能够重现生理相关分化程序的表皮类器官模型中应用 Perturb-seq。我们证明，我们施加的扰动会显著影响多样化的分化程序，并揭示了非经典 NF-κB 信号传导在晚期角质形成细胞分化中的双向作用。
利益冲突声明
已声明的资助信息
NIH T32 AR00711
Dermatology Foundation， https://ror.org/04xy3z086
NIH R35GM145235 UM1HG011996
Foundation for Ichthyosis and Related Skin Types
Pachyonychia Congenita Project
NSF 2201538
版权
本预印本的。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
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发表于 2026 年 7 月 23 日。
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Galen Squiers， Benjamin A Nanes， Maggie Balas， Joshua J Lingo， Lei Wang， Huan Zhou， Sabahat Munawar， Mpathi Nzima， Gary C Hon， Jason Klein
bioRxiv 2026.07.22.739901； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.22.739901
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Perturb-seq解析表皮类器官中的生理程序及非经典NF-κB信号传导的双向调控
Galen Squiers， Benjamin A Nanes， Maggie Balas， Joshua J Lingo， Lei Wang， Huan Zhou， Sabahat Munawar， Mpathi Nzima， Gary C Hon， Jason Klein
bioRxiv 2026.07.22.739901； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.22.739901
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.22.739901v1?rss=1
🏷️ Perturb-seq 表皮类器官 角质形成细胞分化 非经典NF-κB信号 单细胞CRISPR筛选