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当核糖体遇到问题密码子或扰乱翻译过程的细胞应激时,会发生停滞。停滞的核糖体可导致核糖体碰撞的形成,也称为二聚核糖体(disome),并由此激活细胞监视与应激信号通路。在基础条件下会形成多少二聚核糖体,以及应激状态下二聚核糖体水平如何变化,目前仍知之甚少。 在本研究中,我们采用加入外源参照并经标准化的 Ribo-seq 和 Disome-seq,对全转录组范围内的二聚核糖体水平进行了定量。在酵母和人细胞中应用该方法后,我们发现,在基础条件下,二聚核糖体约占正在翻译的核糖体总数的 2%–10%。在人细胞中进行的一项高分辨率 Disome-seq 实验鉴定出可重复检测到的二聚核糖体形成位点,这些位点共同促成了细胞内基础水平的二聚核糖体形成。 将酵母细胞暴露于甲基磺酸甲酯、将人细胞暴露于茴香霉素后,二聚核糖体丰度最高可增加至四倍,并且碰撞的分布以应激特异性和情境依赖性的方式发生变化。总体而言,这些数据为测定二聚核糖体水平提供了一个定量的、全转录组范围的分析框架,并揭示了翻译应激如何重塑细胞内核糖体碰撞的图谱。
sezen.meydan{at}vanderbilt.edu
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摘要
当核糖体遇到有问题的密码子或扰乱翻译过程的细胞应激时,会发生停滞。停滞的核糖体可导致核糖体碰撞的形成,也称为二聚核糖体(disome),从而激活细胞监视和应激信号通路。在基础条件下会形成多少二聚核糖体,以及在应激下二聚核糖体水平如何变化,仍然知之甚少。持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文属于美国政府作品。根据《美国法典》第 17 编第 105 条,其不受版权保护,并且还以 CC0 许可提供使用。
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发布于 2026 年 7 月 22 日。
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基础及应激诱导核糖体碰撞的定量分析
James Marks , Pedro H Ayres-Galhardo , Bavavarshini Tamilselvam , Alexis B Roberson , Ruby Pitts , Nicholas R Guydosh , Sezen Meydan
bioRxiv 2026.07.21.739814; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739814
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基础及应激诱导核糖体碰撞的定量分析
James Marks , Pedro H Ayres-Galhardo , Bavavarshini Tamilselvam , Alexis B Roberson , Ruby Pitts , Nicholas R Guydosh , Sezen Meydan
bioRxiv 2026.07.21.739814; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739814
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.21.739814v1?rss=1
🏷️ 核糖体碰撞 Disome-seq Ribo-seq 翻译应激 全转录组定量分析