基础状态及应激诱导的核糖体碰撞的定量分析

root 提交于 周四, 07/23/2026 - 10:47
当核糖体遇到问题密码子或扰乱翻译过程的细胞应激时,会发生停滞。停滞的核糖体可导致核糖体碰撞的形成,也称为二聚核糖体(disome),并由此激活细胞监视与应激信号通路。在基础条件下会形成多少二聚核糖体,以及应激状态下二聚核糖体水平如何变化,目前仍知之甚少。 在本研究中,我们采用加入外源参照并经标准化的 Ribo-seq 和 Disome-seq,对全转录组范围内的二聚核糖体水平进行了定量。在酵母和人细胞中应用该方法后,我们发现,在基础条件下,二聚核糖体约占正在翻译的核糖体总数的 2%–10%。在人细胞中进行的一项高分辨率 Disome-seq 实验鉴定出可重复检测到的二聚核糖体形成位点,这些位点共同促成了细胞内基础水平的二聚核糖体形成。 将酵母细胞暴露于甲基磺酸甲酯、将人细胞暴露于茴香霉素后,二聚核糖体丰度最高可增加至四倍,并且碰撞的分布以应激特异性和情境依赖性的方式发生变化。总体而言,这些数据为测定二聚核糖体水平提供了一个定量的、全转录组范围的分析框架,并揭示了翻译应激如何重塑细胞内核糖体碰撞的图谱。

sezen.meydan{at}vanderbilt.edu

摘要 信息/历史 指标 补充材料 数据/代码 预览 PDF

摘要

当核糖体遇到有问题的密码子或扰乱翻译过程的细胞应激时,会发生停滞。停滞的核糖体可导致核糖体碰撞的形成,也称为二聚核糖体(disome),从而激活细胞监视和应激信号通路。在基础条件下会形成多少二聚核糖体,以及在应激下二聚核糖体水平如何变化,仍然知之甚少。持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文属于美国政府作品。根据《美国法典》第 17 编第 105 条,其不受版权保护,并且还以 CC0 许可提供使用。

返回顶部 上一篇 下一篇

发布于 2026 年 7 月 22 日。

下载 PDF 补充材料 数据/代码 电子邮件

感谢您有意帮助传播 bioRxiv。

您的电子邮件 *

您的姓名 *

发送至 *

请输入多个地址,每行一个,或用逗号分隔。

您将要通过电子邮件发送以下内容

基础及应激诱导核糖体碰撞的定量分析

邮件主题

(您的姓名)已从 bioRxiv 转发一个页面给您

邮件正文

(您的姓名)认为您可能会希望查看 bioRxiv 网站上的此页面。

您的个人留言

验证码

此问题用于测试您是否为人类访客,并防止自动化垃圾信息提交。

分享

基础及应激诱导核糖体碰撞的定量分析

James Marks , Pedro H Ayres-Galhardo , Bavavarshini Tamilselvam , Alexis B Roberson , Ruby Pitts , Nicholas R Guydosh , Sezen Meydan

bioRxiv 2026.07.21.739814; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739814

分享本文:

复制

引用工具

基础及应激诱导核糖体碰撞的定量分析

James Marks , Pedro H Ayres-Galhardo , Bavavarshini Tamilselvam , Alexis B Roberson , Ruby Pitts , Nicholas R Guydosh , Sezen Meydan

bioRxiv 2026.07.21.739814; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739814


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.21.739814v1?rss=1

🏷️ 核糖体碰撞 Disome-seq Ribo-seq 翻译应激 全转录组定量分析