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某些流感病毒的血凝素（HA）可以与主要组织相容性复合体II类分子（MHC-II）相互作用，但这些蛋白质如何发生相互作用尚不清楚。本文证明，不同类型的H5 HA可以利用MHC-II进入细胞，并且对于大多数H5 HA而言，禽类MHC-II比人类MHC-II更能高效介导其入胞。 为界定其分子相互作用界面，我们采用假病毒深度突变扫描，测量H5 HA突变如何影响其与簇绒鸭MHC-II的相互作用，并鉴定出将HA限制为仅与MHC-II或唾液酸受体结合的突变。我们进一步利用能够增强H5 HA与簇绒鸭MHC-II结合的突变，解析了该复合物分辨率为4.8埃的冷冻电镜模型。 为支持这一结构模型，我们测量了簇绒鸭MHC-II全部突变对其与H5 HA相互作用的影响，发现α链是主导性决定因素，但位于肽结合沟槽附近的β链位点也有贡献。为推广这些发现，我们通过深度突变扫描表明，H7 HA与MHC-II的相互作用方式与H5 HA相似。 最后，我们表明H1、H2、H3和H9 HA也可与禽类或人类MHC-II相互作用，尽管这种相互作用在不同宿主中进化而来的毒株之间存在差异。
jbloom{at}fredhutch.org
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摘要
某些流感病毒的血凝素（HA）可与主要组织相容性复合体 II 类（MHC-II）相互作用，但这些蛋白如何相互作用尚不清楚。在此，我们证明了多种 H5 亚型 HA 可利用 MHC-II 进入细胞，并且对于大多数 H5 亚型 HA，禽类 MHC-II 比人类 MHC-II 能更高效地介导进入。为界定分子界面，我们采用假病毒深度突变扫描测量 H5 HA 的突变如何影响其与凤头潜鸭 MHC-II 的相互作用，并鉴定出将 HA 限制为仅与 MHC-II 或唾液酸受体相互作用的突变。我们利用对能够增强 H5 HA 与凤头潜鸭 MHC-II 结合的突变的鉴定结果，解析了该复合物一个 4.8 Å 分辨率的冷冻电镜模型。为支持这一结构模型，我们测量了凤头潜鸭 MHC-II 的所有突变如何影响其与 H5 HA 的相互作用，发现 alpha 链是主导性决定因素，但靠近肽结合槽的 beta 链位点也有贡献。为推广这些发现，我们使用深度突变扫描表明，一种 H7 亚型 HA 与 MHC-II 的相互作用方式与 H5 HA 相似。最后，我们显示 H1、H2、H3 和 H9 亚型 HA 可与禽类或人类 MHC-II 相互作用，尽管这种相互作用在不同宿主中进化的毒株之间存在差异。
利益冲突声明
J.D.B. 和 B.D. 是 Fred Hutch 已授权专利的发明人，这些专利与假病毒深度突变扫描相关；此外，他们还是一项关于 MHC-II 结合缺陷型 HA 疫苗抗原的临时专利的发明人。J.D.B. 为 Apriori Bio、GSK、Merck 和 Pfizer 提供咨询服务。J.D.B. 持有 Vaccine Company 的股票期权。N.P.K. 是 AstraZeneca 的付费顾问。
脚注
https://dms-vep.org/Flu-H5N1-American-Wigeon-2021-HA-tufted-duck-MHCII-…
https://dms-vep.org/Flu-H7-Anhui13-MHCII-binding/
https://dms-vep.org/Tufted-duck-MHCII-DMS/
已声明资助信息
美国国家过敏与传染病研究所 ，75N93021C00015 ，U19AI181881
美国国家癌症研究所 ，P30CA015704
华盛顿研究基金会， https://ror.org/00hasdx88 ，授予 Sara Sunshine 的博士后奖学金
霍华德·休斯医学研究所， https://ror.org/006w34k90
版权
持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
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发布于 2026 年 7 月 22 日。
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流感血凝素与 MHC-II 之间分子相互作用的界定
Bernadeta Dadonaite ， Annie Dosey ， Jenny J Ahn ， Timothy C Yu ， Sara A Sunshine ， Ariana G Farrell ， Neil P King ， Jesse D Bloom
bioRxiv
2026.07.17.738765；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.07.17.738765
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流感血凝素与 MHC-II 之间分子相互作用的界定
Bernadeta Dadonaite ， Annie Dosey ， Jenny J Ahn ， Timothy C Yu ， Sara A Sunshine ， Ariana G Farrell ， Neil P King ， Jesse D Bloom
bioRxiv
2026.07.17.738765；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.07.17.738765
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.17.738765v1?rss=1
🏷️ 流感血凝素 MHC-II 病毒宿主互作 深度突变扫描 冷冻电镜 受体结合