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生物回路的行为通常通过抽取不确定的动力学参数并进行仿真来发现，但所评估的表型是稳态物种、催化通量、支配关系以及局部响应矩阵的函数。我们提出通量-物种采样（FSS），它直接在该功能层面进行采样，并通过代数方式反演得到参数。这种坐标变换将调控模式转化为简单的支配分区，使每个实现行为的全维参数区域都具有正测度，并且可以在不改变下游稳定性或表型检验的情况下替代现有流程中的采样阶段。一个隔离作用的玩具模型表明，较大的物种参数区域可塌缩为狭窄的参数条带。在一个酶促反馈基元中，FSS 恢复了参数采样所遗漏的自由 A* 适应性，并将该区域识别为非米氏型且由复合体主导。在 MultiFate-N 中，FSS 将采样局限与结构局限区分开来，并恢复了实现全部 2N 个状态的参数集合。
4 工程学院、生命科学学院以及跨学科研究中心，西湖大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有者为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本内容依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 提供。 返回顶部 上一页 下一页 发表于 2026 年 7 月 22 日。 下载 PDF 补充材料 电子邮件 感谢您有兴趣传播 bioRxiv 的内容。 您的电子邮件 * 您的姓名 * 发送至 * 请输入多个地址，每行一个，或用逗号分隔。 您将发送以下内容 通量-物种采样使生物电路行为的整体探索成为可能 消息主题 （您的姓名）从 bioRxiv 向您转发了一个页面 消息正文 （您的姓名）认为您可能会想查看 bioRxiv 网站上的此页面。 您的个人留言 验证码 此问题用于测试您是否为人类访问者，并防止自动垃圾提交。 分享 通量-物种采样使生物电路行为的整体探索成为可能 Qinguo 刘 ， Wenqin 周 ， Xinying 任 ， John P Marken ， 方舟肖 bioRxiv 2026.07.21.739804； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739804 分享本文： 复制 引文工具 通量-物种采样使生物电路行为的整体探索成为可能 Qinguo 刘 ， Wenqin 周 ， Xinying 任 ， John P Marken ， 方舟肖 bioRxiv 2026.07.21.739804； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739804
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