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细菌染色体生物学的研究主要集中于自由生活或与真核生物呈兼性关联的细菌。因此，关于专性动物共生体如何组织其染色体，目前尚不清楚。在此，我们研究了三种定殖于哺乳动物口腔的多细胞奈瑟菌科成员——Alysiella filiformis、Simonsiella muelleri 和 Conchiformibius steedae——的染色体组织。DNA 荧光原位杂交显示，无论其倍性如何，这些细菌的染色体均呈纵向构型，并且 DNA 复制起始位点在整个细胞周期中始终定位于其宿主附着端。免疫定位、ChIP-seq 和 EMSA 结果表明，ParBS 复合物参与维持这一稳定的染色体取向。此外，对两个物种及三种生长条件的染色体构象捕获进一步揭示了保守的、与生活方式相关的染色体架构，包括浮游生长特异性的 ParB 相关染色质环以及条件特异性的染色质边界。综上，我们的研究表明，专性哺乳动物共生体在不受倍性影响的情况下维持稳定的纵向染色体取向，同时根据生理状态重塑更高级别的染色体结构。不同而又保守的染色体架构分别表征对数生长期、静止期以及表面相关生长，表明细菌基因组折叠反映了生活方式与环境背景。
silvia.bulgheresi{at}univie.ac.at
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摘要
细菌染色体生物学的研究主要集中于自由生活或与真核生物兼性共生的细菌。因此，关于专性动物共生体如何组织其染色体，目前尚不清楚。在此，我们研究了三种栖息于哺乳动物口腔的多细胞奈瑟菌科物种——Alysiella filiformis、Simonsiella muelleri 和 Conchiformibius steedae——的染色体组织。DNA 荧光原位杂交显示，不论其倍性如何，它们的染色体均呈纵向构型，且 DNA 复制起始位点在整个细胞周期中始终定位于其宿主接触极。免疫定位、ChIP-seq 和 EMSA 结果表明，ParBS 复合物参与维持这种稳定的染色体取向。此外，跨两个物种及三种生长条件的染色体构象捕获进一步揭示了保守的、与生活方式相关的染色体架构，包括浮游状态特异性的 ParB 相关染色质环，以及条件特异性的染色质边界。
综上，我们的研究表明，专性哺乳动物共生体在不受倍性影响的情况下维持稳定的纵向染色体取向，同时根据生理状态重塑高级染色体结构。指数生长、静止期和表面相关生长分别具有不同但保守的染色体架构，表明细菌基因组折叠反映了生活方式与环境背景。
竞争利益声明
作者声明不存在竞争利益。
资助信息声明
FWF 奥地利科学基金会，P28593，P28743
法国国家研究署（Agence Nationale de la Recherche），ANR-20-CE35-005，ANR-10-INBS-09
版权
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发布于 2026 年 7 月 21 日。
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哺乳动物共生体中保守的、与生活方式相关的染色体架构
Tobias Viehboeck， Nicole Krause， Philipp Moritz Weber， Eanna O'Shea， Valentin Noetzel， Nika Pende， Hanna Goelles-Kirth， Nelle Varoquaux， Frederic Boccard， Ivan Junier， Virginia S. Lioy， Silvia Bulgheresi
bioRxiv 2026.07.20.739713；doi：https://doi.org/10.64898/2026.07.20.739713
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哺乳动物共生体中保守的、与生活方式相关的染色体架构
Tobias Viehboeck， Nicole Krause， Philipp Moritz Weber， Eanna O'Shea， Valentin Noetzel， Nika Pende， Hanna Goelles-Kirth， Nelle Varoquaux， Frederic Boccard， Ivan Junier， Virginia S. Lioy， Silvia Bulgheresi
bioRxiv 2026.07.20.739713；doi：https://doi.org/10.64898/2026.07.20.739713
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.20.739713v1?rss=1
🏷️ 哺乳动物共生体 染色体结构 纵向构型 ParBS复合物 染色体构象捕获