- 5 次围观
监测环境胁迫下水生生物的生物多样性及生理状态，是水生生态系统管理的核心。环境核酸方法（eDNA 和 eRNA）已革新生物监测，但也存在众所周知的局限，包括易降解、难以区分活体信号与遗留或迁移信号，以及报告生物体状态的能力有限。来自各类物种释放的细胞外囊泡（EVs）在环境中稳定且广泛存在，显示出作为生物标志物的潜力。在此，我们评估从 EVs 中回收的核酸和蛋白质是否可提供一种互补的捕获组分，从而帮助解决上述局限。四种靶标（eDNA、eRNA、EV-DNA、EV-RNA）均采用相同的 12S rRNA 宏条形码工作流程，仅在前分析捕获步骤上不同：环境核酸采用过滤，而 EV 包封组分则采用 0.22 μm 逐级过滤、切向流过滤和超速离心。 在受控水族箱中，EV-DNA 检出全部 7 种参考物种（灵敏度 100%），而总体方法为 85.7%；其中还检出了低丰度的日本鳗鲡（Anguilla japonica），但仍需独立验证。 在杏林湾水库的现场采样中，EV-RNA 检出 12 种预期物种中的 11 种（灵敏度 91.7%），而总体方法仅为 50–58%；其中有 4 个参考类群仅由 EV 组分检出。基于 EV 的方法还捕获到更均衡的群落表征，且 EV-RNA 的人类读段污染低于 eDNA。对水库 EV 的宏蛋白质组学分析检出了鱼类来源蛋白，主要来自鲤鱼（Cyprinus carpio），并包括候选胁迫相关功能蛋白（伴侣蛋白、金属硫蛋白、氧化还原酶），从独立层面印证了基于 EV 的 C. carpio 检测。其丰度随季节变化，表明其具有响应环境变化的能力。 综上，这些结果表明，EV 相关核酸和蛋白质构成一种信息丰富的互补组分，可用于受影响水环境中综合生物多样性与生理信号监测。
作为鱼类生物多样性监测和生理信号恢复的补充组分：细胞外囊泡相关核酸和蛋白质 | bioRxiv 跳至主要内容 首页 关于 提交 警报 / RSS 搜索此关键词 高级搜索 新结果 作为鱼类生物多样性监测和生理信号恢复的补充组分：细胞外囊泡相关核酸和蛋白质 查看 ORCID 个人资料 Jafar Hayatov ， Long Lu ， Xueli Xu ， Yangyu Wu ， Ricardo David Avellan Llaguno ， Alex Obeten Ujong ， Zhizhen Pan ， 查看 ORCID 个人资料 Qiansheng Huang doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.15.735187 Jafar Hayatov 城市环境研究所 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在归作者/资助方所有，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本内容依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 提供。
返回顶部 上一页 下一页 发布于 2026 年 7 月 21 日。 下载 PDF 补充材料 电子邮件 您的电子邮件 * 您的姓名 * 发送至 * 可在不同的行中输入多个地址，或用逗号分隔。 您将发送以下内容 作为鱼类生物多样性监测和生理信号恢复的补充组分：细胞外囊泡相关核酸和蛋白质 消息主题 （您的姓名）已从 bioRxiv 向您转发了一个页面 消息正文 （您的姓名）认为您可能想查看来自 bioRxiv 网站的此页面。 您的个人留言 验证码 此问题用于测试您是否为真人访问者，并防止自动垃圾信息提交。 分享 作为鱼类生物多样性监测和生理信号恢复的补充组分：细胞外囊泡相关核酸和蛋白质 Jafar Hayatov ， Long Lu ， Xueli Xu ， Yangyu Wu ， Ricardo David Avellan Llaguno ， Alex Obeten Ujong ， Zhizhen Pan ， Qiansheng Huang bioRxiv 2026.07.15.735187； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.735187 分享本文： 复制 引文工具 作为鱼类生物多样性监测和生理信号恢复的补充组分：细胞外囊泡相关核酸和蛋白质 Jafar Hayatov ， Long Lu ， Xueli Xu ， Yangyu Wu ， Ricardo David Avellan Llaguno ， Alex Obeten Ujong ， Zhizhen Pan ， Qiansheng Huang bioRxiv 2026.07.15.735187； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.735187
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.15.735187v1?rss=1
🏷️ 细胞外囊泡 环境DNA 鱼类生物监测 宏条形码 宏蛋白质组学