基于孔板的ISD-SPE可实现iPSC来源巨噬细胞中TLR信号的双重蛋白组-分泌组浓度反应分析

蛋白质分泌是细胞信号传导的关键功能性输出，能够捕捉对刺激和药理学扰动的动态响应，而这些响应塑造了免疫行为。在巨噬细胞中，Toll样受体（TLR）的激活会驱动受到严格调控的分泌程序，从而介导炎症反应，并为通路活性提供具有生物学意义的读出。尽管基于质谱（MS）的分泌组学能够对这些过程进行无偏倚分析，但其在药物发现中的更广泛应用仍受到样品制备流程限制可扩展性的制约。在此，我们描述了一种基于孔板的溶液内消化与固相萃取（ISD-SPE）工作流程，该流程可对条件培养基进行96孔处理，并实现从同一样本孔中对蛋白质组和分泌组进行整合分析。与基于沉淀的方法进行基准比较表明，该流程在蛋白质组覆盖深度方面具有可比性，同时提高了定量重复性，并在多个孔板间表现出稳健性能。结合dia-PASEF采集方式，该工作流程能够对巨噬细胞对TLR激活的响应进行深入分析，解析TLR3、TLR4和TLR7/8激活后受体特异性的分泌程序。将该方法扩展至浓度-反应研究后，能够对细胞内和细胞外蛋白质图谱中的药理学扰动进行定量表征，揭示TLR抑制中共有的以及区室特异性的响应，以及与分泌动力学相关的表观效力差异。总体而言，该工作流程为细胞内信号传导及其下游蛋白质分泌的整合分析提供了一种可扩展的策略，从而能够在系统层面表征炎症反应和化合物作用机制。

| bioRxiv 跳至主内容 首页 关于 提交 警报 / RSS 搜索此关键词 高级搜索 帮助 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于帮助 广告 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于广告 编委会 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于编委会 关于我们 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于我们 患者 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于患者 广告主 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于广告主 机构 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于机构 订阅者 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于订阅者 审稿人 2013-08-15 周四 16:02 -- hwadmin 阅读更多 关于审稿人 作者 2013-08-15 周四 16:02 --

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.17.739077v1?rss=1

🏷️ TLR信号 巨噬细胞 分泌组学 蛋白质组学 浓度-反应分析 iPSC来源细胞