保守折叠使免疫拮抗作用跨越生命树实现

root 提交于 周三, 07/22/2026 - 20:47
人类先天免疫的许多组成部分在原核生物中是保守的。尽管已知病原体能够逃避免疫宿主防御,但这种免疫逃逸机制在整个生命树上是否也具有同样深远的进化或功能保守性,仍在很大程度上未得到解决。本文通过建立病毒汇编数据库(The Viral Compendium,TVC)系统地探讨这一问题。TVC收录了来自真核、细菌和古菌病毒的超过35万种蛋白质和79万个结构域。我们发现,蛋白质结构比对能够识别出跨病毒的蛋白质和结构域簇,相较于基于序列的方法,显著提高了病毒蛋白的注释率。结构域共关联分析揭示了1,351种在古菌、真核和细菌病毒中保守的结构域组合,其中包括可重构Mre11-Rad50多蛋白复合体核酸酶-ATP酶核心的融合蛋白,该复合体参与细胞DNA修复。借助结构比较,我们识别出广泛共享、介导免疫抑制的结构折叠:由病毒和细菌病原体编码、可降解核苷酸信使的保守磷酸二酯酶折叠,以及真核和原核病毒中均采用、用于抑制细胞感知的双链RNA结合结构域。综上,我们的结果表明,病原体的免疫逃逸建立在保守的结构性构件之上,揭示了贯穿所有生命域的免疫拮抗统一机制及效应分子。

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摘要 人类先天免疫的许多组分在原核生物中是保守的。尽管已知病原体会逃避免疫宿主防御,但免疫逃逸机制是否在生命树中也具有类似深远的进化或功能保守性,仍在很大程度上未得到解决。持有者为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC 4.0 International license 发布。

返回顶部 上一页 下一页 发表于 2026年7月21日。 下载 PDF

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引文工具 生命树中保守折叠促进免疫拮抗 Lorenzo Profeta , Erin E Doherty , Johanna M Ebner , Gauri Deak Unal , Emili A Arasa-Verge , Logan Poehlman , Avi Shukla , Michael S Kikugawa , Aniyah L Barnett , Tristan X Jordan , Wali Malik , Jason Nomburg bioRxiv 2026.07.21.739742; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739742


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🏷️ 病毒蛋白结构域 免疫逃逸 结构保守性 跨生命域 蛋白质结构比对