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表观遗传机制提供了精细的调控层级,可在多种生物中调节基因表达,然而其在非双核亚界真菌(non-dikarya fungi, NDF)中的组织方式及相互串扰仍知之甚少。在此,我们表征了真菌小孢根霉(Rhizopus microsporus)全基因组范围内的染色质组织图谱,揭示出一种区室化架构,其中活性组蛋白修饰(H3K4me1、H3K4me3、H3K27ac)界定了转录活跃的常染色质,并与H3K9me3标记的组成型异染色质相区分。通过系统性的ChIP-seq分析,我们证明这些修饰在基因体区域上呈现出不同的分布模式,并与6-甲基腺嘌呤(6mA)簇(MACs)共定位;6mA是该真菌中一种与转录相关的关键表观遗传标记。我们鉴定出H3K4甲基转移酶Set1旁系同源物之间存在功能特化,其中Set1a主要催化H3K4me3的沉积,而Set1b则催化H3K4me1的沉积。相比之下,两个Gcn5旁系同源物在H3K27乙酰化中发挥冗余功能。敲除分析表明,这些酶对孢子形成、抗逆性和致病性至关重要。重要的是,我们揭示了一种表观遗传串扰机制,其中活性组蛋白修饰限制6mA的脱靶沉积,调控甲基化簇的稳定性,并缓冲转录变异。我们的研究结果揭示了活性组蛋白修饰与必需DNA修饰6mA之间表观遗传串扰的保守原则,这可能代表真核生物中染色质调控的一种基本机制。
活性组蛋白修饰精细调控 DNA N-6-甲基腺嘌呤沉积并维持转录稳定性 | bioRxiv
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Victoriano Garre
doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739721
Carlos Lax 1 穆尔西亚大学生物学院; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可,不得重复使用。
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发表于 2026 年 7 月 21 日。
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活性组蛋白修饰精细调控 DNA N-6-甲基腺嘌呤沉积并维持转录稳定性
Carlos Lax, Macario Osorio-Concepción, Natalia Nicolás-Muñoz, Ghizlane Tahiri, Stephen J Mondo, Vivian Ng, Eusebio Navarro, Igor V Grigoriev, Victor Meza-Carmen, Francisco E. Nicolás, Victoriano Garre
bioRxiv 2026.07.21.739721; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739721
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活性组蛋白修饰精细调控 DNA N-6-甲基腺嘌呤沉积并维持转录稳定性
Carlos Lax, Macario Osorio-Concepción, Natalia Nicolás-Muñoz, Ghizlane Tahiri, Stephen J Mondo, Vivian Ng, Eusebio Navarro, Igor V Grigoriev, Victor Meza-Carmen, Francisco E. Nicolás, Victoriano Garre
bioRxiv 2026.07.21.739721; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.21.739721
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.21.739721v1?rss=1
🏷️ 表观遗传调控 组蛋白修饰 DNA 6mA甲基化 ChIP-seq 真菌染色质 转录稳定性