脓毒症中小鼠骨髓浆细胞样树突状细胞和造血祖细胞的CITE-seq研究

摘要：该数据集包含来自脓毒症和假手术小鼠的骨髓细胞单细胞转录组和表面蛋白谱，这些骨髓细胞富集了浆细胞样树突状细胞（pDCs）和造血祖细胞群。脓毒症通过对 BALB/c 野生型小鼠实施中度盲肠结扎穿孔术（cecal ligation and puncture，CLP）诱导，假手术作为对照。术后 36 小时采集骨髓，经荧光激活细胞分选去除特定谱系阳性细胞后，采用通过测序对转录本和表位进行细胞索引（Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing，CITE-seq）进行处理。样本拆分采用 hashtag 寡核苷酸完成。该数据集包括 13,725 个细胞的基因表达矩阵、抗体衍生标签计数以及条形码分配信息，其中假手术与 CLP 样本在总细胞数中分布相当。该数据集可用于研究脓毒症中骨髓细胞的转录状态、表面标志物表达和表型多样性；也可用于与其他免疫学和血液学单细胞数据集进行比较，或用于训练和基准评估多模态单细胞数据分析计算工具。

摘要：该数据集包含来自脓毒症和假手术小鼠的骨髓细胞的单细胞转录组和表面蛋白谱，这些细胞富集了浆细胞样树突状细胞（pDCs）和造血祖细胞群。通过对 BALB/c 野生型小鼠进行中度严重程度的盲肠结扎穿孔术（cecal ligation and puncture，CLP）诱导脓毒症，以假手术作为对照。术后 36 小时采集骨髓，经荧光激活细胞分选去除特定谱系阳性细胞后，采用通过测序进行转录组和表位细胞索引（Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing，CITE-seq）进行处理。样本拆分采用条形码寡核苷酸（hashtag oligonucleotides）完成。该数据集包括 13,725 个细胞的基因表达矩阵、抗体衍生标签计数以及条形码分配信息，其中假手术与 CLP 样本在总细胞数中的分布相当。该数据集可用于研究脓毒症中骨髓细胞的转录状态、表面标志物表达及表型多样性，与其他免疫学和血液学单细胞数据集进行比较，或用于训练和评估多模态单细胞数据分析的计算工具。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.15.738715v1?rss=1

🏷️ 脓毒症 骨髓单细胞 浆细胞样树突状细胞 造血祖细胞 CITE-seq 表面蛋白组