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基于生成式人工智能的蛋白质设计能够为所需功能创造多样化结构,但为人类设计者提供的三维架构控制能力有限。我们开发了 ProteinSketch,这是一个双手操作的虚拟现实平台,可直接创建沉浸式骨架草图和体积包络,并将其转化为基于扩散的蛋白质生成约束。基于 RFdiffusion 的实时优化实现了对用户指定蛋白质拓扑结构的交互式探索与构建。对草绘包络进行体积条件约束,实现了对非等距几何形状的高保真控制,并经冷冻电子显微镜证实。这些用户定义的体积约束支持了功能性结合蛋白的设计,并可将既有微型结合蛋白延伸至在复杂分子环境中采用传统设计方法难以接近的表面。该人机协作框架将人类空间推理与生成式人工智能相结合,用于空间定向、形状可控的蛋白质结构与功能设计。
ProteinSketch 通过虚拟现实中的双手交互将空间直觉转化为蛋白质设计 | bioRxiv
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ProteinSketch 通过虚拟现实中的双手交互将空间直觉转化为蛋白质设计
Donghyeok Ma,
Junyup Lee,
Heechan Lee,
Sang-Hyun Lee,
Yeong Gyeong Oh,
Ye-eun Kim,
Taegyu Jin,
Siripon Sutthiwanna,
Seung-Jun Lee,
Woosung Jeon,
Jinsook Ahn,
Ryeongeun Cho,
Hyemi Park,
Seongin Jeong,
Hahnbeom Park,
Seok-Hyung Bae,
Ho Min Kim
doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739460
Donghyeok Ma 1 韩国科学技术院(KAIST)产业设计学系,韩国大田 34141;
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本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 7 月 20 日。
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Donghyeok Ma, Junyup Lee, Heechan Lee, Sang-Hyun Lee, Yeong Gyeong Oh, Ye-eun Kim, Taegyu Jin, Siripon Sutthiwanna, Seung-Jun Lee, Woosung Jeon, Jinsook Ahn, Ryeongeun Cho, Hyemi Park, Seongin Jeong, Hahnbeom Park, Seok-Hyung Bae, Ho Min Kim
bioRxiv 2026.07.19.739460; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739460
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ProteinSketch 通过虚拟现实中的双手交互将空间直觉转化为蛋白质设计
Donghyeok Ma, Junyup Lee, Heechan Lee, Sang-Hyun Lee, Yeong Gyeong Oh, Ye-eun Kim, Taegyu Jin, Siripon Sutthiwanna, Seung-Jun Lee, Woosung Jeon, Jinsook Ahn, Ryeongeun Cho, Hyemi Park, Seongin Jeong, Hahnbeom Park, Seok-Hyung Bae, Ho Min Kim
bioRxiv 2026.07.19.739460; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739460
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.19.739460v1?rss=1
🏷️ 蛋白质设计 虚拟现实交互 生成式人工智能 扩散模型 三维结构控制