染色质相关环状RNA(cacRNAs)的表征

root 提交于 周二, 07/21/2026 - 20:47
环状RNA(circRNA)通过以时空特异性的方式与多种蛋白质和RNA相互作用,已成为新型基因表达调控因子。定位于细胞质中的circRNA通过结合微小RNA和RNA结合蛋白(RBP)来调控mRNA的翻译或稳定性,而定位于细胞核中的circRNA则通过与转录因子和剪接因子相关联来调控转录和前体mRNA剪接。在本研究中,我们旨在探索circRNA与染色质之间的相互作用。对已发表的染色质组分RNA-seq数据进行分析,在多种人类细胞中鉴定出数百个染色质相关circRNA(cacRNA)。我们验证了部分circRNA在染色质组分中的富集,并在HEK293T细胞中证实了circDYNC1H1和circKIF2C与染色质的直接相互作用。此外,还发现cacRNA可与RBP发生相互作用。综上,我们的研究揭示了数百个circRNA与染色质的全局性关联,并拓展了我们对circRNA新型功能层面的认识。

环状RNA(circRNA)通过以时空特异性的方式与多种蛋白质和RNA相互作用,已成为新型基因表达调控因子。定位于细胞质中的circRNA通过结合微小RNA和RNA结合蛋白(RBP)来调控mRNA的翻译或稳定性,而位于细胞核中的circRNA则通过与转录因子和剪接因子相关联来调控转录和前体mRNA剪接。在本研究中,我们旨在探索circRNA与染色质之间的相互作用。通过分析已发表的来自染色质组分的RNA-seq数据,我们在多种人类细胞中鉴定出数百个染色质相关circRNA(cacRNA)。我们验证了部分circRNA在染色质组分中的富集,并在HEK293T细胞中证实了circDYNC1H1和circKIF2C与染色质的直接相互作用。此外,我们还发现cacRNA能够与RBP相互作用。综上,我们的研究揭示了数百个circRNA与染色质的全局性关联,并拓展了我们对circRNA新型功能层面的认识。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.20.739476v1?rss=1

🏷️ 环状RNA 染色质互作 cacRNA RNA-seq分析 基因表达调控 RNA结合蛋白