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与HLA-A和HLA-B限制性应答相比，HLA-C限制性的CD8+ T细胞应答仍然缺乏明确界定，尽管HLA-C作为肽呈递分子以及杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIR）的配体均具有核心作用。这种双重功能为基于pHLA多聚体的抗原特异性T细胞分析带来了重大挑战，因为HLA-C多聚体可通过抗原特异性的TCR或KIR与CD8+ T细胞结合。 在此，我们表明，CD8+ T细胞上的KIR表达会驱动非TCR依赖性的pHLA-C多聚体结合，从而导致对HLA-C限制性抗原特异性T细胞应答的高估。通过采用HLA不匹配供体体系以及癌症新抗原pHLA-C多聚体，我们证明了表面上呈多聚体阳性的CD8+ T细胞可能来源于KIR介导的识别，而非同源TCR特异性。我们进一步表明，在pHLA-C多聚体染色前进行KIR阻断能够去除非TCR特异性结合；并将该策略应用于对CMV、EBV和SARS-CoV-2抗原的大规模分析后，我们鉴定出TCR特异性的HLA-C限制性CD8+ T细胞群体。 重要的是，KIR介导的pHLA-C结合并非在所有肽-HLA-C复合物中均一发生，而是具有肽选择性。单细胞转录组、表型和克隆型分析进一步表明，KIR介导和TCR介导的pHLA-C多聚体结合界定了在转录和克隆层面均彼此不同的CD8+ T细胞群体。综上，这些发现确立了KIR介导的pHLA-C识别是HLA-C多聚体基础T细胞分析中的一个主要混杂因素。通过区分KIR介导与TCR介导的结合，我们的方法为在病毒感染和癌症背景下准确发现并表征HLA-C限制性抗原特异性CD8+ T细胞提供了一个实用框架。
与HLA-A和HLA-B限制性应答相比，HLA-C限制性CD8+ T细胞应答仍然界定不清，尽管HLA-C作为肽呈递分子以及杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIR）的配体都具有核心作用。这种双重功能为基于pHLA多聚体的抗原特异性T细胞分析带来了重大挑战，因为HLA-C多聚体可通过抗原特异性TCR或KIR与CD8+ T细胞结合。
在此，我们表明，CD8+ T细胞上的KIR表达会驱动不依赖TCR的pHLA-C多聚体结合，从而导致对HLA-C限制性抗原特异性T细胞应答的高估。通过采用HLA错配供体体系和癌症新抗原pHLA-C多聚体，我们证明，表面上呈多聚体阳性的CD8+ T细胞可能源于KIR介导的识别，而非同源TCR特异性。我们进一步表明，在进行pHLA-C多聚体染色之前阻断KIR可去除非TCR特异性的结合；并将这一策略应用于对CMV、EBV和SARS-CoV-2抗原的大规模分析，从而鉴定出TCR特异性的HLA-C限制性CD8+ T细胞群体。重要的是，KIR介导的pHLA-C结合具有肽选择性，而不是在所有肽-HLA-C复合物中均一发生。单细胞转录组、表型和克隆型分析进一步证明，KIR介导和TCR介导的pHLA-C多聚体结合界定了转录特征和克隆组成均不同的CD8+ T细胞群体。
综上，这些发现确立了KIR介导的pHLA-C识别是基于HLA-C多聚体的T细胞分析中的一个主要混杂因素。通过区分KIR介导与TCR介导的结合，我们的方法为在病毒感染和癌症背景下准确发现并表征HLA-C限制性抗原特异性CD8+ T细胞提供了一个切实可行的框架。
作者声明不存在竞争性利益。
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🏷️ KIR受体 CD8+T细胞 HLA-C限制性应答 pHLA多聚体 抗原特异性检测 单细胞转录组