利用宏基因组组装基因组解析共胞藻类细菌群落的基因组学特征

共核藻类是指发生核分裂而不发生胞质分裂、从而形成多核细胞的生物。关于共核藻类细菌群落的大多数研究采用了16S rRNA测序，且主要聚焦于绿藻中共核藻类的布里乌普西目（Bryopsidales）。近期研究分析了来自多个类群藻类宿主（如绿藻门、褐藻门和红藻门）的宏基因组组装基因组（MAGs），从而揭示了更多有关细菌生物合成机制及潜在共生关系的信息。鉴于共核藻类如Bryopsis、Caulerpa、Codium以及黄绿藻Vaucheria具有世界性分布及独特形态特征，有必要进一步深入了解其相关细菌群落。为此，研究人员使用Illumina NovaSeq仪器对Vaucheria bursata LB2067的丝状体进行了测序，并对所有公开可获得的来自共核藻类的短读长和长读长数据集进行了筛查，以回收MAGs。来自布里乌普西目（Bryopsidales）和管藻目（Vaucheriales）的所有回收MAGs在门水平上均表现出变形菌门（Pseudomonadota）的高度优势，但在目或科水平上未见一致模式。与非共核类群相比，来自共核目中的MAGs普遍表现出某些特定KEGG通路的高完整性，例如双向多聚磷酸代谢和核黄素生物合成。值得注意的是，N-乙酰谷氨酰胺基谷氨酰胺酰胺（NAGGN）生物合成基因簇（BGCs）仅发现于来自共核目的MAGs中，而多糖利用位点（PULs）则存在于所有分析的MAGs中。这些结果表明，与共核藻类相关的细菌群落具有复杂性，并具备适应富有挑战性且多变环境的多样化生存策略。

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利用宏基因组组装基因组解析共质体藻类细菌群落的基因组学见解

Gerardo Laureano，

Xochitl Ramirez，

Ashley Scoles，

Christina Johne，

Coralys M Colon，

Yerlianys Hernandez Ortiz，

Jennyfer Soleyman，

Ramon E Rivera Vicens，

ALOK ARUN

doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739436

Gerardo Laureano 1 波多黎各美洲大学巴兰基塔斯校区，波多黎各，美国；

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发布于 2026年7月19日。

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Ashley Scoles，

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Coralys M Colon，

Yerlianys Hernandez Ortiz，

Jennyfer Soleyman，

Ramon E Rivera Vicens，

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bioRxiv 2026.07.19.739436； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739436

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利用宏基因组组装基因组解析共质体藻类细菌群落的基因组学见解

Gerardo Laureano，

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Ashley Scoles，

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Yerlianys Hernandez Ortiz，

Jennyfer Soleyman，

Ramon E Rivera Vicens，

ALOK ARUN

bioRxiv 2026.07.19.739436； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.19.739436

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.19.739436v1?rss=1

🏷️ 宏基因组组装基因组 共胞藻类 细菌群落 共生关系 功能基因组学 生物合成基因簇