菲律宾一种新型野生小丑鱼杂交种的发现及其基因组特征分析

杂交在海洋鱼类中广泛存在，并且能够促进适应、分化以及新型表型的产生。在小丑鱼中，目前仅描述了两种野生杂交种——Amphiprion leucokranos 和 A. thiellei，然而这些自然发生的小丑鱼杂交个体仍然鲜有记录。这两种杂交均涉及与 A. sandaracinos 的杂交。 在菲律宾的野外调查期间，我们鉴定出一个此前未被记录的小丑鱼个体，其具有异常表型，同时类似于 A. sandaracinos 和 A. perideraion。为表征其起源，我们结合基因组、线粒体和表型数据，并将其与先前已描述的小丑鱼杂交系统进行比较。全基因组主成分分析（PCA）和群体遗传混合分析支持其具有 A. sandaracinos 与 A. perideraion 的混合祖先成分。线粒体基因组重建结果将该个体归入 A. sandaracinos 的线粒体谱系。 综合来看，这些结果支持其杂交起源，并提示其以 A. sandaracinos 祖先成分为主，这与其作为回交后代而非第一代杂交体的解释一致。与此前已表征的杂交种 A. leucokranos 的比较进一步揭示了在独立形成的小丑鱼杂交系统之间，基因组组成和表型方面存在相似性。我们的研究发现了一种此前未被记录的天然小丑鱼杂交类型，并表明结合基因组学与野外调查的方法，可能揭示更多隐蔽的杂交系统，并增进对小丑鱼杂交现象的理解。

杂交在海洋鱼类中广泛存在，并且可促进适应、分化以及新表型的产生。在小丑鱼中，目前仅描述了两种野生杂交种，即 Amphiprion leucokranos 和 A. thiellei，然而这些自然发生的小丑鱼杂交个体仍鲜有记录。这两种杂交类型均涉及与 A. sandaracinos 的杂交。在菲律宾的野外调查期间，我们发现了一个此前未被记录的小丑鱼个体，其异常表型同时类似于 A. sandaracinos 和 A. perideraion。为表征其起源，我们结合基因组、线粒体以及表型比较，并将其与先前描述的小丑鱼杂交系统进行对照分析。全基因组主成分分析（PCA）和群体混合分析支持其具有 A. sandaracinos 与 A. perideraion 的混合祖先来源。线粒体基因组重建结果表明，该个体归属于 A. sandaracinos 的线粒体谱系。综合来看，这些结果支持其杂交起源，并提示其以 A. sandaracinos 祖先成分为主，这与其为回交后代而非第一代杂交个体相一致。与先前已表征的杂交种 A. leucokranos 的比较进一步揭示，在独立形成的小丑鱼杂交系统之间，其基因组组成和表型存在相似性。我们的研究鉴定出一种此前未被记录的天然小丑鱼杂交类型，并表明结合基因组学与野外调查方法，可能揭示更多隐蔽的杂交系统，并增进对小丑鱼杂交现象的理解。

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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.14.738406v1?rss=1

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