谁为开放数据共享提供资金?生物医学论文中数据可用性声明的分析

root 提交于 周一, 07/20/2026 - 22:47
开放数据共享日益成为研究资助机构、期刊和机构的强制性要求,但大规模合规性测量仍然面临挑战。我们分析了2024年1月至2025年6月期间发表的784,262篇开放获取生物医学研究论文,采用双源流程:在可获得PDF的情况下进行基于PDF的文本提取(MinerU),否则使用PMC XML,随后通过算法检测数据共享声明(oddpub v7.2.3),并结合来自OpenAlex的资助方、期刊和机构元数据进行扩充。该语料库包括256,660篇有PDF覆盖的文章(32.7%)和527,602篇仅有XML的文章(67.3%)。我们发现总体开放数据率为8.7%,而在与资助方相关联的文章(即元数据中识别出至少一位资助方的文章)中,这一比例上升至11.7%。在整个科研生态系统中,这一比率的差异超过十倍:主要资助机构中的领先者观测到的开放数据率达到20–24%,而顶级期刊达到70–86%;在对仅XML覆盖的局限性进行校正后,修正估计值最高可达92.9%(《Nature Genetics》)。在相同文章上,基于PDF的检测比基于XML的方法多识别出约52%的数据共享声明。这些观测到的比率在资助机构和期刊之间存在显著差异,而当前总体共享水平仍远低于普遍合规。这些模式提供了一个实证基线,可据此衡量未来政策变化。利益相关方可通过交互式仪表板 https://www.opensciencemetrics.org 浏览并基准比较这些结果。

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谁为开放数据共享提供资助?生物医学出版物中数据可用性声明的分析

查看 ORCID 个人资料 Josh Lawrimore , Christoph Li , 查看 ORCID 个人资料 Dustin Moraczewski , 查看 ORCID 个人资料 Jean-Baptiste Poline , 查看 ORCID 个人资料 Adam Thomas

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.17.739022

Josh Lawrimore 1 癌症研究弗雷德里克国家实验室临床监测研究项目平台主管机构;

在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文属于美国政府作品。根据《美国法典》第 17 编第 105 条,其不受版权保护,并同时依据 CC0 许可提供使用。

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发布于 2026 年 7 月 20 日。

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Josh Lawrimore , Christoph Li , Dustin Moraczewski , Jean-Baptiste Poline , Adam Thomas

bioRxiv 2026.07.17.739022; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.17.739022

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Josh Lawrimore , Christoph Li , Dustin Moraczewski , Jean-Baptiste Poline , Adam Thomas

bioRxiv 2026.07.17.739022; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.17.739022


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.17.739022v1?rss=1

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