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穿山甲是极度濒危的哺乳动物，在圈养期间常遭受高发的胃肠道疾病，但肠道病毒组在其健康中的作用尚未得到探索。本研究首次对不同健康状态下马来穿山甲（Manis javanica）和中华穿山甲（M. pentadactyla）肠道DNA病毒组进行了全面表征。对来自健康、腹泻、肺炎、野外活动和死亡穿山甲的16份粪便样本进行宏病毒组测序后，每个样本获得了7.2–11.8 Gb的高质量数据。患病和死亡个体中噬菌体比例显著降低（94.5% vs. 53.3%，P = 0.02），同时真核病毒显著增加。死亡中华穿山甲中，虹彩病毒科（Iridoviridae，38%）和多分DNA病毒科（Polydnaviridae，34%）占据主导。SIMPER分析表明，细小病毒科（Parvoviridae）是健康与患病马来穿山甲之间病毒组差异的主要贡献者，而虹彩病毒科和多分DNA病毒科则是中华穿山甲中的关键贡献者。KEGG功能注释显示，与DNA复制、修复和重组相关的基因最为丰富，提示穿山甲肠道病毒组内可能存在频繁的基因组重组。 穿山甲肠道病毒组与健康状态密切相关。疾病会诱导病毒组由噬菌体主导转变为真核病毒主导，其中细小病毒科和虹彩病毒科分别成为马来穿山甲和中华穿山甲中潜在致病病毒的候选类群。这些发现为穿山甲保护中的病毒组监测提供了分子证据，并强调了在救护中心开展针对细小病毒的定向监测的必要性。
获救穿山甲肠道病毒组多样性与健康状态：宏病毒组学揭示细小病毒为与疾病相关的关键病毒 | bioRxiv
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获救穿山甲肠道病毒组多样性与健康状态：宏病毒组学揭示细小病毒为与疾病相关的关键病毒
Wenjing Jiao， Zhi Liao Zeng， Xinyuan Hu， Jianfeng Deng， Jinping Chen
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.738944
Wenjing Jiao 1 中国环境科学研究院；
Zhi Liao Zeng 2 深圳市自然保护区管理局；
Xinyuan Hu 3 深圳市自然保护区管理局；
Jianfeng Deng 2 深圳市自然保护区管理局；
Jinping Chen 4 广东省科学院动物研究所
通讯作者： chenjp{at}giz.gd.cn
摘要 信息/历史 指标 预览 PDF
摘要
穿山甲是极度濒危的哺乳动物，在圈养期间胃肠道疾病发生率较高，然而肠道病毒组在其健康中的作用仍未得到探索。持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可不得再利用。
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发布于 2026 年 7 月 16 日。
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获救穿山甲肠道病毒组多样性与健康状态：宏病毒组学揭示细小病毒为与疾病相关的关键病毒 Wenjing Jiao， Zhi Liao Zeng， Xinyuan Hu， Jianfeng Deng， Jinping Chen bioRxiv 2026.07.16.738944； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.738944
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.16.738944v1?rss=1
🏷️ 穿山甲 肠道病毒组 宏病毒组学 细小病毒科 胃肠道疾病 野生动物保护