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细菌来源的氮杂双环羧氨酸酯及相关的吡咯里西啶生物碱在微生物相互作用中发挥重要作用，并且是具有治疗潜力的骨架结构。它们的生物合成涉及一个双模块非核糖体肽合成酶（NRPS），以及一个Baeyer–Villiger单加氧酶和多种修饰酶；后者促成了这些化合物的结构多样化。 由主要人体机会致病菌铜绿假单胞菌产生的核心代谢物 azetidomonamide A 是一种罕见的4,7-双环羧氨酸酯，参与调控细菌毒力，属于一类以ClpP蛋白酶为靶标的独特天然产物家族。在本研究中，我们阐明了形成该7元环环状羧氨酸酯战头的全部反应步骤，并在体外重构了 azetidomonamide A 的生物合成过程。 值得注意的是，该方法使我们能够通过对NRPS系链中间体进行化学捕获，详细表征由缩合（C）结构域催化的在线脱水反应。此外，我们鉴定出脱水酶 AzeD，证明其是C结构域家族中一类独立存在蛋白的奠基成员。通过结合结构分析、对接分析和生物化学分析，我们提供了证据表明，AzeD 的催化机制不同于脱水型C结构域，从而进一步拓展了对这些关键生物合成酶已知化学功能的认识。
铜绿假单胞菌来源氮杂双环氨基甲酸酯的全生物合成鉴定出不同的脱水型缩合家族蛋白 | bioRxiv
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铜绿假单胞菌来源氮杂双环氨基甲酸酯的全生物合成鉴定出不同的脱水型缩合家族蛋白
Xiaohan Liu， Soumaya Najah， Andrea Calderari， Zhilai Hong， Sebastien Halary， Carine Lombard， Arnaud Bolard， Katy Jeannot， Arnaud Gruez， Kira J. Weissman， Yanyan LI
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.17.738954
Xiaohan Liu 1 MCAM单元，UMR 7245 CNRS-MNHN，法国巴黎； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予bioRxiv永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0国际许可协议 提供。
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发布于 2026年7月17日。
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Xiaohan Liu， Soumaya Najah， Andrea Calderari， Zhilai Hong， Sebastien Halary， Carine Lombard， Arnaud Bolard， Katy Jeannot， Arnaud Gruez， Kira J. Weissman， Yanyan LI
bioRxiv 2026.07.17.738954； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.17.738954
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铜绿假单胞菌来源氮杂双环氨基甲酸酯的全生物合成鉴定出不同的脱水型缩合家族蛋白
Xiaohan Liu， Soumaya Najah， Andrea Calderari， Zhilai Hong， Sebastien Halary， Carine Lombard， Arnaud Bolard， Katy Jeannot， Arnaud Gruez， Kira J. Weissman， Yanyan LI
bioRxiv 2026.07.17.738954； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.17.738954
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.17.738954v1?rss=1
🏷️ 天然产物生物合成 非核糖体肽合成酶 铜绿假单胞菌 脱水缩合结构域 Baeyer–Villiger单加氧酶 酶催化机制