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沙眼是一种由沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis, Ct）引起的慢性眼部疾病，是全球范围内导致失明的首要感染性病因。尽管世界卫生组织已实施SAFE策略（手术、抗生素、面部清洁、环境改善），仍约有1亿人面临失明风险。利用宏基因组鸟枪法测序，我们对埃塞俄比亚阿姆哈拉地区680名村民的眼部微生物组进行了表征，鉴定出10种与不同人群特征相关的群落状态类型（Community State Types, CSTs）。炎症性沙眼和Ct患病率最高的儿童集中于CST10，该类型以流感嗜血杆菌（Haemophilus influenzae）和另外4种嗜血杆菌属物种为优势菌。瘢痕性沙眼患病率最高的成人集中于CST3和CST6，这两种类型均以麦金利棒状杆菌（Corynebacterium macginleyi）为优势菌。CST5以猪支原体（Mesomycoplasma hyorhinis）和金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）为优势菌，Ct和沙眼患病率最低，且是唯一未检出人畜共患衣原体属物种的CST。作为一种人畜共患的猪源细菌，M. hyorhinis与S. aureus均具有形成生物被膜的能力，这可能通过竞争性阻止或下调衣原体感染。其他CST则以弧菌属（Vibrio）等环境来源物种为优势菌。这是首个针对沙眼建立CST的微生物组研究。致病性及潜在保护性微生物与人口学、临床及衣原体相关特征呈现出明确不同的关联，这将为设计作为抗生素替代方案的微生物治疗策略以及制定世界卫生组织全球消除致盲性沙眼项目的相关策略提供指导。
眼部群落状态类型揭示微生物组间不同的微生物组成，并对沙眼防控具有启示意义 | bioRxiv
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眼部群落状态类型揭示微生物组间不同的微生物组成，并对沙眼防控具有启示意义
Augusta Uwamanzu-Nna， Olusola Olagoke， Charlotte Xiaoyi Shi， Hiwot Degineh Mengistie， Kaleb Asfaha， Timothy D. Read， Deborah Dean
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.738988
Augusta Uwamanzu-Nna 1 加州大学旧金山分校医学院； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文根据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 7 月 17 日。
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Augusta Uwamanzu-Nna， Olusola Olagoke， Charlotte Xiaoyi Shi， Hiwot Degineh Mengistie， Kaleb Asfaha， Timothy D. Read， Deborah Dean
bioRxiv 2026.07.16.738988； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.738988
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眼部群落状态类型揭示微生物组间不同的微生物组成，并对沙眼防控具有启示意义
Augusta Uwamanzu-Nna， Olusola Olagoke， Charlotte Xiaoyi Shi， Hiwot Degineh Mengistie， Kaleb Asfaha， Timothy D. Read， Deborah Dean
bioRxiv 2026.07.16.738988； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.738988
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.16.738988v1?rss=1
🏷️ 眼部微生物组 沙眼 群落状态类型 宏基因组测序 沙眼衣原体