由群体GWAS推断的现存基因组变异可预测欧洲山毛榉幼苗干旱存活实验结果

root 提交于 周六, 07/18/2026 - 18:47
在全球气候变化的驱动下,中欧地区不断加剧的干旱格局正对森林更新构成日益严重的威胁,其中幼苗阶段是欧洲山毛榉(Fagus sylvatica)等长寿命树种的首要种群统计学瓶颈。尽管已有研究记录了山毛榉幼苗在耐旱性方面的种内表型变异,但这种变异的基因组基础仍知之甚少。现有的种源试验方法能够捕捉广义遗传力,却缺乏识别特定因果位点所需的分辨率。为弥补这一空白,我们对欧洲山毛榉幼苗开展了受控土壤干旱实验,并进行了群体水平的全基因组关联研究(GWAS),同时利用个体存活时长作为直接的适合度代理指标。我们检测到不同群体间的存活持续时间存在显著差异(10–40天),并在候选位点上观察到相应的等位基因频率差异,这些位点的功能注释在一定程度上反映了已知的环境胁迫响应。值得注意的是,来源于官方种子库的幼苗相较于野外采集材料始终表现较差,这表明当前的种子来源实践可能无意中削弱了适应性遗传多样性。我们的结果表明,自然欧洲山毛榉种群中现存的基因组变异能够预测幼苗在干旱条件下的差异性存活,并且在自然遗传多样性得以保留的情况下,该物种仍保有应对长期春季干旱的显著遗传潜力。这些发现对于预测气候情景下的辅助迁移策略和种子来源指南具有直接意义。

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由群体GWAS推断的现有基因组变异可预测欧洲山毛榉(Fagus sylvatica)幼苗干旱存活实验结果

Linda Eberhardt,Friederike Reuss,Markus Pfenninger

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.13.738179

Linda Eberhardt 1 Senckenberg 生物多样性与气候研究中心; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有者为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本作品采用 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议发布。

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发布于 2026年7月17日。

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Linda Eberhardt, Friederike Reuss, Markus Pfenninger

bioRxiv 2026.07.13.738179; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.13.738179

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由群体GWAS推断的现有基因组变异可预测欧洲山毛榉(Fagus sylvatica)幼苗干旱存活实验结果

Linda Eberhardt, Friederike Reuss, Markus Pfenninger

bioRxiv 2026.07.13.738179; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.13.738179


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.13.738179v1?rss=1

🏷️ 欧洲山毛榉 干旱耐受 全基因组关联分析 幼苗存活 适应性遗传变异