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产吲哚克雷伯菌物种复合群（Klebsiella oxytoca species complex, SC）是一个新兴的医疗相关机会致病菌群。荚膜多糖是其毒力决定因子，也是新型疫苗、单克隆抗体和噬菌体治疗的靶点。在缺乏广泛可及的表型分型技术的情况下，基于全基因组测序数据预测荚膜类型，对于理解荚膜多样性及其流行病学特征，以及确定应优先作为新型抗产吲哚克雷伯菌物种复合群干预措施靶点的荚膜类型，具有关键意义。 本文提出首个针对产吲哚克雷伯菌物种复合群的综合性荚膜合成位点（K位点）数据库。该数据库包含88个依据基因组成界定的不同位点，并与快速基因组分型工具Kaptive兼容。该数据库对公开可获得的产吲哚克雷伯菌物种复合群基因组具有较高覆盖率（在总计4,055个基因组中去冗余得到的2,244个基因组中，覆盖率为97.6%），且其分型率显著高于既有的克雷伯菌K位点数据库（97.6% 对 50.3%，p肺炎克雷伯菌氧化亚种物种复合群荚膜多糖合成位点数据库 | bioRxiv
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肺炎克雷伯菌氧化亚种物种复合群荚膜多糖合成位点数据库
查看 ORCID 个人资料 Melinda Ashcroft， 查看 ORCID 个人资料 Naoise McGarry， 查看 ORCID 个人资料 Thomas D Stanton， 查看 ORCID 个人资料 Lesley Hoyles， 查看 ORCID 个人资料 Kathryn E Holt， 查看 ORCID 个人资料 Kelly L Wyres
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.739023
Melinda Ashcroft 1 莫纳什大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开提供。
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发布于 2026 年 7 月 17 日。 下载 PDF 补充材料 数据/代码 电子邮件
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Melinda Ashcroft， Naoise McGarry， Thomas D Stanton， Lesley Hoyles， Kathryn E Holt， Kelly L Wyres
bioRxiv 2026.07.16.739023； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.739023
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肺炎克雷伯菌氧化亚种物种复合群荚膜多糖合成位点数据库
Melinda Ashcroft， Naoise McGarry， Thomas D Stanton， Lesley Hoyles， Kathryn E Holt， Kelly L Wyres
bioRxiv 2026.07.16.739023； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.739023
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.16.739023v1?rss=1
🏷️ 克雷伯菌 荚膜多糖 K位点数据库 全基因组分型 Kaptive 基因组监测