高分辨率空间转录组学解析胶质细胞亚细胞特化

root 提交于 周六, 07/18/2026 - 14:47
脑中的细胞具有复杂的结构,并带有延伸出的突起。这种复杂的形态支持其在健康与疾病状态下多样化的专门功能;尤其是,细胞突起似乎对于细胞整合与信号传导至关重要。在本研究中,我们开发了一种新的空间平均框架,用于在空间转录组学(ST)数据中恢复并解析胶质细胞突起的分子表型。我们在小鼠和人脑组织中表征了与星形胶质细胞和小胶质细胞突起相关的细胞类型特异性特征。相较于胞体,星形胶质细胞突起富集了与神经元支持相关的转录本,而小胶质细胞突起则优先表达与特定小胶质细胞状态相关的基因。 当在具有阿尔茨海默病(AD)病理的脑组织中进行研究时,我们发现,无论是在淀粉样β小鼠模型中,还是在人类AD患者组织中,局部淀粉样β病理均与转录组的亚细胞差异相关。具体而言,朝向淀粉样β斑块的星形胶质细胞和小胶质细胞突起,与延伸至无斑块区域的突起相比,表现出不同的分子变化,这提示胶质细胞对病理存在极化响应。因此,我们的工作提出了一种通用方法,可在小鼠和人类ST数据中选择性表征胶质细胞突起的转录组特征,并为健康和疾病状态下胶质细胞胞体与突起之间存在差异性转录组响应提供了证据。

a.mallach{at}imperial.ac.uk

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摘要

大脑中的细胞具有带有延伸突起的复杂结构。这种复杂形态支持了健康与疾病状态下多种多样的特化功能,尤其是细胞突起似乎对细胞整合与信号传导至关重要。在此,我们开发了一种新的空间平均框架,用于在空间转录组学(ST)数据中恢复并解析胶质细胞突起的分子表型。我们在小鼠和人脑组织中表征了与星形胶质细胞和小胶质细胞突起相关的细胞类型特异性标志。与胞体相比,星形胶质细胞突起富集了与神经元支持相关的转录持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 发布。

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发布于 2026 年 7 月 17 日。 下载 PDF 补充材料 电子邮件

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Samuel L Boulger, Leire Melgosa-Ecenarro, Magdalena Zielonka, Kjara S Pilch, Sasvi S Wijesinghe, Carola I Radulescu, Paul M Matthews, Samuel J Barnes, Anna Mallach

bioRxiv 2026.07.12.737168; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.12.737168

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Samuel L Boulger, Leire Melgosa-Ecenarro, Magdalena Zielonka, Kjara S Pilch, Sasvi S Wijesinghe, Carola I Radulescu, Paul M Matthews, Samuel J Barnes, Anna Mallach

bioRxiv 2026.07.12.737168; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.12.737168


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