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鸟类疟原虫在疟色虫类群中构成了一个高流行率且遗传多样性极高的类群，然而，与感染人类和啮齿动物的对应类群相比，它们长期以来一直被忽视。其中，血变形虫属（Haemoproteus；蜱传孢子虫目 Haemosporida，血变形虫科 Haemoproteidae）寄生虫是鸟类中分布广泛且流行率高的血液寄生虫，由虱蝇科（Hippoboscidae）和蠓科（Ceratopogonidae）昆虫传播。近期的系统基因组学分析表明，血变形虫属寄生虫位于疟色虫系统树的基部，因此，这些分类群的基因组数据对于理解疟原虫的进化起源至关重要。迄今为止，仅有两个鸟类疟原虫属（Plasmodium）基因组和一个鸟类血变形虫属基因组被测序。我们报道了常见于雀形目鸟类血液寄生虫——大血变形虫（Haemoproteus majoris，谱系 WW2）的首个组装基因组。由于鸟类红细胞具有细胞核，在全基因组扩增之前，采用基于荧光激活细胞分选（FACS）的分选方法富集寄生虫DNA，以区分并分离寄生虫与宿主细胞核。该基因组采用 Nanopore 长读长测序进行组装，并结合 Illumina 短读长数据进行校正，最终获得145个contig，总组装大小为23.9 Mb，G+C 含量为27.85%。基因组注释鉴定出5501个蛋白编码基因、69个非编码RNA基因，以及57个长末端重复逆转座子（LRT-RTs），其中包括1个全长元件。该基因组资源的建立，是阐明鸟类疟原虫进化历史及其基因组结构的关键一步。
鸟类疟原虫 Haemoproteus majoris（谱系 WW2）的基因组及其与其他 Plasmodium 物种的关系 | bioRxiv
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鸟类疟原虫 Haemoproteus majoris（谱系 WW2）的基因组及其与其他 Plasmodium 物种的关系
Amelie Bardil， Arnaud Berthomieu， Jacques Dainat， Michael C. Fontaine， Olof Hellgren， Ana Rivero， Thomas D Otto， Sylvain Gandon
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.13.738139
Amelie Bardil 1 CEFE, CNRS, Univ. Montpellier, EPHE, IRD, 法国； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 7 月 17 日。
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Amelie Bardil， Arnaud Berthomieu， Jacques Dainat， Michael C. Fontaine， Olof Hellgren， Ana Rivero， Thomas D Otto， Sylvain Gandon
bioRxiv 2026.07.13.738139； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.13.738139
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鸟类疟原虫 Haemoproteus majoris（谱系 WW2）的基因组及其与其他 Plasmodium 物种的关系
Amelie Bardil， Arnaud Berthomieu， Jacques Dainat， Michael C. Fontaine， Olof Hellgren， Ana Rivero， Thomas D Otto， Sylvain Gandon
bioRxiv 2026.07.13.738139； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.13.738139
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.13.738139v1?rss=1
🏷️ 鸟类疟原虫 Haemoproteus majoris 基因组组装 系统基因组学 进化关系 Nanopore测序