电荷编码的变阻器允许Skp1中螺旋成核但限制其延伸

root 提交于 周五, 07/17/2026 - 08:47
由内在无序区域(IDRs)介导的分子识别通常被认为涉及折叠与结合的偶联过程,然而,调控这一转变的序列特征仍缺乏充分研究。在此,我们表明,SCF 泛素连接酶衔接蛋白 Skp1 的无序 C 端片段——螺旋 8(H8)——由于其自身的序列语法而在内在上被阻止形成稳定螺旋。通过采用一种整合性方法解析其构象动力学,我们发现 H8 经常成核形成螺旋结构,但很少进一步传播成为完全形成的稳定螺旋;相反,它主要占据一个由螺旋中间体构成的浅层亚稳态能盆。与传统的螺旋-无规卷曲交换模型不同,在后者中成核是限速步骤,而 H8 中的螺旋起始则容易发生,其传播却被一个富含谷氨酸的酸性斑块选择性抑制。该酸性区段充当一种对电荷敏感的构象流变调节器,限制螺旋延伸,并使 H8 维持在以无序状态为主的构象中。因此,H8 在微秒时间尺度上瞬时采样部分螺旋构象,而不会进入稳定折叠状态。我们提出,这种传播受限机制在保持构象柔性的同时,也维持了其对一个结构多样的 F-box 结合伙伴家族的识别能力。更广泛地说,我们的研究结果表明,带电-疏水-带电的序列模式可作为一种普遍的组织原则,在内在无序蛋白质组中编码有条件的、依赖上下文的结构。

sarath.dantu{at}brunel.ac.uk

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由内在无序区(IDRs)介导的分子识别通常被认为涉及折叠与结合的偶联过程,然而,调控这一转变的序列特征仍未得到充分探索。持有人为作者/资助方,其已授权 bioRxiv 永久展示该预印本。

本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。

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发布于 2026 年 7 月 16 日。

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一种电荷编码的变阻器允许 Skp1 中的螺旋成核但限制其传播

Debarghya Mitra , Simran Tolani , Amrita Bhattacharya , Supriya Prathihar , Sagarjyoti Pathak , Arpita Prasad , Christian Griesinger , Ashutosh Kumar , Sarath Chandra Dantu

bioRxiv

2026.07.13.737693;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.07.13.737693

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一种电荷编码的变阻器允许 Skp1 中的螺旋成核但限制其传播

Debarghya Mitra , Simran Tolani , Amrita Bhattacharya , Supriya Prathihar , Sagarjyoti Pathak , Arpita Prasad , Christian Griesinger , Ashutosh Kumar , Sarath Chandra Dantu

bioRxiv

2026.07.13.737693;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.07.13.737693


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.13.737693v1?rss=1

🏷️ 内在无序区域 蛋白质构象动力学 螺旋成核与延伸 Skp1 序列电荷编码