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肺动脉高压（PAH）代表一组异质性疾病，涉及复杂的分子失调，而这些失调无法被单一组学分析充分捕捉。我们将基于网络的多组学分析框架 DrDimont 应用于 PAH 患者与对照者肺微血管内皮细胞的转录组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学以及激酶筛选数据。由此，我们扩展了 DrDimont 的功能，使其在构建条件特异性多组学网络时能够纳入激酶—激酶相互作用。激酶相互作用通过对筛选底物的磷酸化进行推断，并以激酶—底物预测结果加权。在 PAH 与对照之间开展基于网络的差异相互作用评分分析后，我们发现了以激酶为中心的改变，尤其是与 MAPK 信号传导相关的主要命中分子，如 MAPK13、MAP2K 或其上游 IRAK1，以及其他 MAPK/MAP2K 家族成员。其他差异显著较高的节点包括 ACADSB、GPX7、DSE（蛋白质层面）以及 AIM1、LY96、CHSY3（mRNA 层面）。 当通过将药物靶点映射到差异网络上来优先排序候选药物时，我们发现药物他克莫司（FK506）以及若干抗肿瘤 MAPK 抑制剂（如 selumetinib、trametinib）具有较高评分，此外，还有通过作用于一般增殖过程中的（线粒体）DNA 转录发挥效应的药物（如表柔比星、拓扑替康）。将激酶活性筛选整合到我们可解释的、基于网络的多组学分析中，揭示了 PAH 中以激酶为中心的改变及治疗假说，这些发现补充了基于单层数据的经典差异表达分析。
肺动脉高压微血管内皮细胞差异性多组学分析用于差异性药物反应 | bioRxiv
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用于差异性药物反应的肺动脉高压微血管内皮细胞差异性多组学分析
Pauline Hiort，Astrid Weiss，Janina Krentz，Ralph T Schermuly，Harm-Jan Bogaard，Tim Conrad，Robert Szulcek，Katharina Baum
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737730
Pauline Hiort 1 柏林自由大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 7 月 16 日。
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Pauline Hiort，Astrid Weiss，Janina Krentz，Ralph T Schermuly，Harm-Jan Bogaard，Tim Conrad，Robert Szulcek，Katharina Baum
bioRxiv 2026.07.10.737730； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737730
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用于差异性药物反应的肺动脉高压微血管内皮细胞差异性多组学分析
Pauline Hiort，Astrid Weiss，Janina Krentz，Ralph T Schermuly，Harm-Jan Bogaard，Tim Conrad，Robert Szulcek，Katharina Baum
bioRxiv 2026.07.10.737730； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737730
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.10.737730v1?rss=1
🏷️ 肺动脉高压 多组学分析 微血管内皮细胞 激酶信号通路 MAPK通路 药物反应