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丙型肝炎病毒（HCV）是一种嗜肝性病毒，可导致一系列肝脏疾病。HCV 的遗传多样性会影响其传播、发病机制、预后以及对抗病毒治疗的应答。此外，耐药相关替代（RASs）对现有抗病毒治疗构成了挑战。然而，关于埃塞俄比亚流行基因型及 RASs 的数据仍然有限。因此，本研究旨在确定表面健康献血者中的 HCV 基因型和 RASs。 本研究使用了 97 份存档的抗-HCV 阳性血清样本，这些样本来源于表面健康的献血者，并按照国家常规采血规范收集。采用基于扩增子的二代测序方法，对其中 45 份样本的 HCV NS5B 基因部分片段进行扩增和测序。基因型和亚基因型采用 NCBI BLAST、Geno2Pheno[hcv] 以及 Los Alamos HCV 数据库进行判定，并通过系统发育树加以确认。RASs 采用 Geno2Pheno[hcv] 进行判定。 在 97 份抗-HCV 阳性样本中，45 份可检测到 HCV RNA，其中 35 份获得了高质量序列。这些毒株（n = 35）在 NS5B 基因序列上表现出显著同质性：34 株为 HCV 基因型 4，且均为 4d 亚基因型；1 株为 HCV 基因型 2，亚基因型为 2c。大多数毒株携带与利巴韦林相关的 RAS D310N，而未检测到与索磷布韦耐药相关的 RASs。 HCV 基因型呈现同质性，以 HCV 基因型 4，尤其是 HCV 4d 亚基因型为主。未发现主要的索磷布韦相关 RASs，但利巴韦林相关的 RAS D310N 较为常见。未来研究应采用更广泛的地理采样和全基因组测序，以全面表征 RASs 及其分布、临床意义和时间变化趋势，从而为埃塞俄比亚的治疗策略制定提供指导。
埃塞俄比亚献血者中丙型肝炎病毒基因型高度同质性及缺乏主要索非布韦耐药相关替代 | bioRxiv
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埃塞俄比亚献血者中丙型肝炎病毒基因型高度同质性及缺乏主要索非布韦耐药相关替代
Helen Terefe，Tadelo Wondmagegn，Abaysew Ayele，Dawit Hailu Alemayehu，Gashaw Adane，Yimer Demisse，Gizachew Gemechu，Adane Mihret，Tesfaye Gelanew，Andargachew Mulu
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.738611
Helen Terefe 1 阿姆奥尔·汉森研究所； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本作品依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 7 月 16 日。 下载 PDF 电子邮件
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埃塞俄比亚献血者中丙型肝炎病毒基因型高度同质性及缺乏主要索非布韦耐药相关替代
Helen Terefe，Tadelo Wondmagegn，Abaysew Ayele，Dawit Hailu Alemayehu，Gashaw Adane，Yimer Demisse，Gizachew Gemechu，Adane Mihret，Tesfaye Gelanew，Andargachew Mulu
bioRxiv 2026.07.15.738611； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.738611
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埃塞俄比亚献血者中丙型肝炎病毒基因型高度同质性及缺乏主要索非布韦耐药相关替代
Helen Terefe，Tadelo Wondmagegn，Abaysew Ayele，Dawit Hailu Alemayehu，Gashaw Adane，Yimer Demisse，Gizachew Gemechu，Adane Mihret，Tesfaye Gelanew，Andargachew Mulu
bioRxiv 2026.07.15.738611； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.738611
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.15.738611v1?rss=1
🏷️ 丙型肝炎病毒 基因分型 耐药相关替代 索磷布韦 NS5B基因 二代测序