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儿科癌症被认为源于发育程序的失调，而这些程序原本在时间和空间上都受到严格调控。婴儿型大脑半球胶质瘤（infant-type hemispheric gliomas，IHGs）发生于儿童早期，其驱动因素为具有特征性的ALK/ROS1/MET/NTRK受体酪氨酸激酶（RTK）基因融合。我们利用单细胞和单核RNA/ATAC测序以及空间转录组学，对24例融合阳性胶质瘤（涵盖婴儿至青少年年龄段）进行了细胞层级解析。我们鉴定出五种癌细胞状态，其中放射状胶质样细胞位于肿瘤性层级的顶端，该层级类似于神经元样和胶质样分化轨迹。神经元样细胞在大多数IHGs中富集，但在ROS1融合型IHGs及年龄较大的患者中减少。染色质谱分析的整合表明，所有癌细胞群体中均存在由FOS/JUN驱动的致癌程序以及较高的推定可塑性。作为数量最多的非肿瘤性细胞群，髓系细胞由不同亚群构成，提示其功能具有情境依赖性。尽管缺乏高阶结构，空间转录组学仍揭示了IHGs内部离散的细胞生态位。总体而言，我们的研究结果阐明了IHGs以及年龄较大患者中RTK融合型胶质瘤的基础细胞状态和发育程序，为相关研究和治疗创新开辟了新路径。
单细胞多组学分析解析婴幼儿及年长儿童中 ALK/ROS1/MET/NTRK 融合型胶质瘤的细胞多样性 | bioRxiv
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婴幼儿及年长儿童中 ALK/ROS1/MET/NTRK 融合型胶质瘤的单细胞多组学分析揭示其细胞多样性
Andrea J. De Micheli，Carlos O.A. de Biagi-Junior，Costanza Lo Cascio，Charbel Machaalani，Andreas Postlmayr，Shashank Katiyar，Roetlje Maas，Venkatesh Kancherla，Regina Reimann，Michal Zapotocky，Liana F. Nobre，Sebastian K. Eder，Jacob S. Rozowsky，Theo Ribierre，Fides Zenk，Adam Resnick，Matthew Clarke，Johannes Gojo，Uri Tabori，Cynthia Hawkins，Chris Jones，Florence M. G. Cavalli，Mariella G. Filbin，Ana S. Guerreiro Stucklin
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.738862
Andrea J. De Micheli 1 瑞士苏黎世大学儿童医院儿童研究中心肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Carlos O.A. de Biagi-Junior 2 美国马萨诸塞州波士顿 Dana-Farber 波士顿儿童癌症与血液疾病中心儿科肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Costanza Lo Cascio 2 美国马萨诸塞州波士顿 Dana-Farber 波士顿儿童癌症与血液疾病中心儿科肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Charbel Machaalani 1 瑞士苏黎世大学儿童医院儿童研究中心肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Andreas Postlmayr 3 瑞士苏黎世大学儿童医院肿瘤科及儿童研究中心； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Shashank Katiyar 2 美国马萨诸塞州波士顿 Dana-Farber 波士顿儿童癌症与血液疾病中心儿科肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Roetlje Maas 4 瑞士苏黎世大学儿童医院肿瘤科及儿童研究中心；瑞士苏黎世大学医院神经病理学研究所； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Venkatesh Kancherla 3 瑞士苏黎世大学儿童医院肿瘤科及儿童研究中心； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Regina Reimann 5 瑞士苏黎世大学医院神经病理学研究所； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Michal Zapotocky 6 捷克布拉格查理大学第二医学院及莫托尔大学医院儿科血液与肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Liana F. Nobre 7 加拿大阿尔伯塔省埃德蒙顿阿尔伯塔大学儿科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Sebastian K. Eder 8 美国马萨诸塞州波士顿 Dana-Farber 波士顿儿童癌症与血液疾病中心儿科肿瘤科；英国大奥蒙德街儿童医院 NHS 基金会信托神经病理学科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Jacob S. Rozowsky 2 美国马萨诸塞州波士顿 Dana-Farber 波士顿儿童癌症与血液疾病中心儿科肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Theo Ribierre 9 瑞士日内瓦 Campus Biotech 神经NA人类细胞神经科学平台；瑞士日内瓦大学基础神经科学系； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Fides Zenk 10 瑞士埃居布朗洛桑联邦理工学院生命科学学院脑智研究所神经发育表观基因组学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Adam Resnick 11 美国宾夕法尼亚州费城费城儿童医院生物医学数据驱动发现中心（D3b）；美国宾夕法尼亚州费城费城儿童医院神经外科；美国宾夕法尼亚州费城费城儿童医院肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Matthew Clarke 12 英国大奥蒙德街儿童医院 NHS 基金会信托神经病理学科；英国癌症研究所癌症生物学部； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Johannes Gojo 13 奥地利维也纳医科大学儿科与青少年医学系、综合癌症中心及儿科综合中心；圣安娜儿童医院，维也纳医科大学儿科与青少年医学系； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Uri Tabori 14 加拿大安大略省多伦多病童医院 Arthur and Sonia Labbatt 脑肿瘤研究中心； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Cynthia Hawkins 14 加拿大安大略省多伦多病童医院 Arthur and Sonia Labbatt 脑肿瘤研究中心； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Chris Jones 15 英国伦敦癌症研究所分子病理学部； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Florence M. G. Cavalli 16 法国巴黎法国国家健康与医学研究院（INSERM）U1331 计算肿瘤学；法国巴黎居里研究所，PSL 大学；法国巴黎 Mines Paris，PSL 大学，CBIO 计算生物学中心 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Mariella G. Filbin 2 美国马萨诸塞州波士顿 Dana-Farber 波士顿儿童癌症与血液疾病中心儿科肿瘤科； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
Ana S. Guerreiro Stucklin 3 瑞士苏黎世大学儿童医院肿瘤科及儿童研究中心； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本站搜索该作者
通讯作者： ana.stuecklin{at}kispi.uzh.ch
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摘要
儿科癌症被认为源于发育程序的失调，而这些程序在正常情况下于时间和空间上均受到严格调控。婴儿型大脑半球胶质瘤（IHGs）发生于幼年早期，其驱动因素为特征性的 ALK/ROS1/MET/NTRK 受体酪氨酸激酶（RTK）基因融合。我们采用单细胞和单核 RNA/ATAC 测序以及空间转录组学，对 24 例融合阳性胶质瘤（覆盖婴儿至青少年年龄范围）进行了细胞层级解析。我们鉴定出五种癌细胞状态，其中放射状胶质样细胞位于肿瘤性层级的顶端，呈现出类似神经元样和胶质样分化轨迹。神经元样细胞在大多数 IHG 中富集，但在 ROS1 融合型 IHG 及年龄较大的患者中减少。染色质分析整合结果显示，由 FOS/JUN 驱动的致癌程序以及所有癌细胞群体中推断出的高度可塑性。作为最丰富的非肿瘤性细胞群，髓系细胞由多个不同亚群构成，提示其功能具有情境依赖性。尽管缺乏高阶结构，空间转录组学仍揭示了 IHG 内部离散的细胞生态位。总体而言，我们的研究结果阐明了 IHG 以及年长患者 RTK 融合型胶质瘤的基础细胞状态和发育程序，为未来研究与治疗创新开辟了新路径。
利益冲突声明
A.G.S. 曾担任 Alexion、TheraMe 和 Novartis 的顾问（代表其所在机构）。 M.G.F. 为 Twentyeight-Seven Therapeutics 和 Blueprint Medicines 的顾问。其他版权
本预印本的。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
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发布于 2026 年 7 月 16 日。
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Andrea J. De Micheli，Carlos O.A. de Biagi-Junior，Costanza Lo Cascio，Charbel Machaalani，Andreas Postlmayr，Shashank Katiyar，Roetlje Maas，Venkatesh Kancherla，Regina Reimann，Michal Zapotocky，Liana F. Nobre，Sebastian K. Eder，Jacob S. Rozowsky，Theo Ribierre，Fides Zenk，Adam Resnick，Matthew Clarke，Johannes Gojo，Uri Tabori，Cynthia Hawkins，Chris Jones，Florence M. G. Cavalli，Mariella G. Filbin，Ana S. Guerreiro Stucklin
bioRxiv 2026.07.16.738862； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.738862
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Andrea J. De Micheli，Carlos O.A. de Biagi-Junior，Costanza Lo Cascio，Charbel Machaalani，Andreas Postlmayr，Shashank Katiyar，Roetlje Maas，Venkatesh Kancherla，Regina Reimann，Michal Zapotocky，Liana F. Nobre，Sebastian K. Eder，Jacob S. Rozowsky，Theo Ribierre，Fides Zenk，Adam Resnick，Matthew Clarke，Johannes Gojo，Uri Tabori，Cynthia Hawkins，Chris Jones，Florence M. G. Cavalli，Mariella G. Filbin，Ana S. Guerreiro Stucklin
bioRxiv 2026.07.16.738862； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.16.738862
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.16.738862v1?rss=1
🏷️ 单细胞多组学 胶质瘤 RTK基因融合 细胞异质性 空间转录组 儿科脑肿瘤