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双组分系统将环境信号转化为转录响应，但同一种响应调节因子的磷酸化状态如何在不同启动子上产生不同输出仍不清楚。本文表明，在铜绿假单胞菌中，启动子结构决定了ParR响应调节因子如何解读磷酸化信号。通过表型、转录组学、生物化学和启动子工程分析，我们发现，ParR保守受体残基Asp57的磷酸化降低了各靶启动子上的DNA占据阈值。然而，不同启动子会将这种共同的结合增强分别转化为激活、抑制或依赖磷酸化的符号转换。染色体上的D57位ParR变体在内源性位点重现了这些行为，并改变了抗生素敏感性、生物被膜形成以及与毒力相关的表型。对代表性启动子的定位与工程改造鉴定出一种两层级顺式调控编码：半位点序列相容性决定ParR是否能够进行有效结合，而间隔长度决定调控的符号与幅度。仅通过间隔区互换即可在不同调控模式之间重编程启动子逻辑。这些发现将调节因子状态与启动子解码区分开来，并表明细菌启动子结构如何使共享磷酸化信号的输出实现多样化。
1 传染病中心，生物治疗国家重点实验室和癌症中心，四川大学华西医院及生物治疗协同创新中心，中国成都；； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可不得再利用。
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发表于 2026 年 7 月 16 日。
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Ziqi Zhu ， Ninglin Zhao ， Yingjie Song ， Dan Fan ， Jianping Ying ， Cheng Nong ， Tonggen Liu ， Chenxi Duan ， Yaping Zheng ， Shuang Zou ， Xingyu Mou ， Haichuan Ma ， Huanxiang Liu ， Rui Bao
bioRxiv 2026.07.15.738673； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.738673
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引文工具 启动子结构使铜绿假单胞菌中依赖 ParR 的转录呈现多样化
Ziqi Zhu ， Ninglin Zhao ， Yingjie Song ， Dan Fan ， Jianping Ying ， Cheng Nong ， Tonggen Liu ， Chenxi Duan ， Yaping Zheng ， Shuang Zou ， Xingyu Mou ， Haichuan Ma ， Huanxiang Liu ， Rui Bao
bioRxiv 2026.07.15.738673； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.738673
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.15.738673v1?rss=1
🏷️ 铜绿假单胞菌 双组分系统 ParR 启动子结构 转录调控 磷酸化信号