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口腔日益被认为是可迁移至肠道并影响肠道微生物组的微生物储库。口腔—肠道微生物轴可能促进慢性胃肠道及肝胆系统疾病的发病过程，包括炎症性肠病（IBD）及其共病原发性硬化性胆管炎（PSC）。为研究IBD和PSC中的口腔—肠道微生物轴，我们纳入了191名参与者，涵盖克罗恩病（CD）、溃疡性结肠炎（UC）、合并PSC的CD（CD_PSC）、合并PSC的UC（UC_PSC）以及健康对照。我们生成并分析了来自唾液、舌拭子和粪便样本的宏基因组鸟枪法全基因组测序数据。 在口腔和肠道生态位中，我们鉴定出多种在UC参与者中相较于健康对照差异性富集的微生物物种，包括唾液中的Fusobacterium nucleatum和Gemella sanguinis、舌部中的Catonella massiliensis和Tannerella serpentiformis，以及粪便中的G. sanguinis和Sellimonas intestinalis。配对的口腔—肠道分析揭示了15种在粪便样本中富集的潜在口腔来源物种；值得注意的是，G. sanguinis和Veillonella rogosae在UC参与者中持续富集。这些发现进一步得到了一个外部验证数据集的支持，该数据集包含来自5个独立IBD队列的1,716份肠道宏基因组，突显了口腔微生物特征的可重复性。在探索性分析中，吸烟史与健康对照口腔微生物组向类似UC状态的转变相关，提示其可能是口腔—肠道微生物轴的环境修饰因素。 总体而言，我们的研究识别了IBD和PSC中独特的口腔微生物特征及其向肠道潜在迁移的现象，强调了口腔—肠道微生物轴在疾病进展中的作用。
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本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 7 月 16 日。
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炎症性肠病和原发性硬化性胆管炎中的口腔-肠道微生物轴
Shanlin Ke， Zihan Zhou， Xiaole Yin， Yiyan Yang， Zheng Sun， Fernanda Quevedo， Nadine Javier， Malav Dave， Katherine Wu， Shaikh Danish Mahmood， Yang-Yu Liu， Joshua R Korzenik
bioRxiv 2026.07.15.738466； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.738466
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炎症性肠病和原发性硬化性胆管炎中的口腔-肠道微生物轴
Shanlin Ke， Zihan Zhou， Xiaole Yin， Yiyan Yang， Zheng Sun， Fernanda Quevedo， Nadine Javier， Malav Dave， Katherine Wu， Shaikh Danish Mahmood， Yang-Yu Liu， Joshua R Korzenik
bioRxiv 2026.07.15.738466； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.15.738466
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.15.738466v1?rss=1
🏷️ 口腔-肠道微生物轴 炎症性肠病 原发性硬化性胆管炎 宏基因组测序 微生物迁移