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核纤层相关结构域(lamina-associated domains,LADs)是与核纤层(nuclear lamina,NL)发生相互作用的大型基因组区域。支配其定位于核周边的底层规则在很大程度上仍不清楚。LADs由异染色质构成,通常携带受抑制的基因,并且它们与NL的关联通常与强烈的转录活性不相容。转录在多大程度上全局塑造染色质-NL相互作用,尚未得到充分理解。 在本研究中,我们将利用Flavopiridol或Triptolide进行的急性转录抑制与全基因组范围的染色质-NL接触图谱绘制相结合。我们发现,转录抑制后染色质-NL相互作用会迅速发生重构。转录关闭后染色质-NL接触的变化可以根据转录活性以及H3K9me3标记异染色质的存在进行预测。这种重构是可逆的,因为在药物洗脱后,基因组-NL相互作用会迅速恢复至基线水平。 值得注意的是,转录关闭后染色质-NL相互作用的增加与减少反映了两种不同的锚定机制。富含高活性基因、位于稳定LAD附近并由Lamin A(LMNA/C)锚定的LAD间基因组区域(inter-LADs,iLADs),在转录抑制后会重新附着于NL。与此同时,由Lamin B受体(LBR)锚定于核膜的H3K9甲基化区域则会大范围地从NL脱离。引人注目的是,LMNA/C和LBR对转录敏感型LADs发挥相反的调控作用,并且对于染色质-NL接触的转录性调控是必需的。 综上,我们的研究结果凸显了染色质-NL相互作用的可塑性和动态特征,并首次证明LMNA/C介导和LBR介导的锚定机制对转录抑制表现出不同的敏感性。
转录通过不同的 Lamin A 和 LBR 锚定机制调控染色质—核纤层接触 | bioRxiv
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转录通过不同的 Lamin A 和 LBR 锚定机制调控染色质—核纤层接触
Marco Bernasconi,Jeremie Breda,Tom van Schaik,Anna Manjon,Federico Zambelli,Giulio Pavesi,Rene H Medema,Marco Muzi-Falconi,Bas van Steensel,Stefano Manzo
doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.14.738400
Marco Bernasconi 1 米兰大学生物科学系; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在限制。任何人均可在不注明原作者的情况下,出于任何目的合法分享、再利用、重混或改编本材料。
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发表于 2026 年 7 月 15 日。 下载 PDF 电子邮件
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Marco Bernasconi,Jeremie Breda,Tom van Schaik,Anna Manjon,Federico Zambelli,Giulio Pavesi,Rene H Medema,Marco Muzi-Falconi,Bas van Steensel,Stefano Manzo
bioRxiv 2026.07.14.738400; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.14.738400
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转录通过不同的 Lamin A 和 LBR 锚定机制调控染色质—核纤层接触
Marco Bernasconi,Jeremie Breda,Tom van Schaik,Anna Manjon,Federico Zambelli,Giulio Pavesi,Rene H Medema,Marco Muzi-Falconi,Bas van Steensel,Stefano Manzo
bioRxiv 2026.07.14.738400; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.14.738400
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.14.738400v1?rss=1
🏷️ 核纤层相关结构域 染色质-核纤层互作 转录抑制 lamin A/C LBR锚定 异染色质重构