MiDAS全球基因组目录：53,501个长读长MAG，代表全球活性污泥微生物组中所有核心原核生物属

废水处理依赖于复杂的微生物群落，然而，这一关键工程生态系统现有的基因组解析参考数据仍主要由短读长组装主导，从而限制了基因组的连续性以及分类学与代谢功能之间的关联。 我们对来自全球83座污水处理厂的活性污泥进行了长读长测序，重建了53,501个宏基因组组装基因组，建立了活性污泥微生物数据库（MiDAS）全球基因组目录。该目录包含12,047个原核生物物种的高质量基因组，其中82%在GTDB第226版中尚无代表；对于我们此前在MiDAS全球16S rRNA基因调查中定义的250个核心原核生物属中的每一个，该目录平均提供32个高质量基因组。 这使得对预测功能性状及其生态学背景的分析成为可能。例如，我们鉴定出两个代表性较低的硝化螺旋菌科属，它们携带保守的亚硝酸盐氧化基因，并在较高温度的污水处理厂中富集。 总之，MiDAS基因组目录为在全球范围内关联废水处理系统中的分类地位、代谢功能与生态角色提供了框架。

废水处理依赖于复杂的微生物群落，然而，针对这一关键人工生态系统的现有基因组解析参考仍主要由短读长组装结果构成，从而限制了基因组连续性以及分类学与代谢功能之间的关联。

我们对来自全球分布的83座污水处理厂的活性污泥进行了长读长测序，重建了53,501个宏基因组组装基因组，建立了活性污泥微生物数据库（MiDAS）全球基因组目录。该目录涵盖了12,047个原核物种的高质量基因组，其中82%在GTDB第226版中未被收录；对于我们此前在MiDAS全球16S rRNA基因调查中定义的250个核心原核属中的每一个，该目录均提供了中位数为32个的高质量基因组。

这使得对预测功能性状及其生态学背景的分析成为可能。例如，我们鉴定出两个代表性较低的Nitrospiraceae科属，它们具有保守的亚硝酸盐氧化基因，并且在较高温度的污水处理厂中丰度较高。总之，MiDAS基因组目录为在全球范围内关联污水处理系统中的分类地位、代谢特征和生态功能提供了一个框架。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.10.737647v1?rss=1

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