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氧化亚氮(N2O)是一种强效温室气体,且主要由不完全反硝化作用产生。尽管我们已知许多参与反硝化的微生物物种,但我们仍无法可靠地预测土壤中的N2O产生。微生物生态学的最新研究表明,当将关键微生物视为功能集合体的成员而非孤立个体时,其活性与涌现性质之间联系的预测能力会显著提高。我们提出假设:在N2O高产期间,活跃微生物群落在分类学上将不同于非活跃部分;并且,N2O产生速率的增加与多个活跃分类单元丰度的共同增加之间的相关性,将强于与单一活跃物种占优势之间的相关性。我们开展了一项微宇宙实验,将农业土壤置于厌氧小瓶中孵育最长15小时,同时追踪N2O的产生。通过将生物正交非经典氨基酸标记与荧光激活细胞分选及16S rRNA扩增子测序(BONCAT-FACS-Seq)相结合,我们探测了整个孵育期间微生物群落中的活跃子集。对16S rRNA基因扩增子的分析表明,活跃组分与非活跃组分包含不同的分类单元,且活跃组分的分类组成会随时间发生变化。我们发现,微生物群落中不足1%的成员即可导致高达3.84 ug N2O-N g干土-1 hr-1的N2O通量速率。活性水平(活跃细胞的荧光强度中位数)与N2O产生速率表现出良好的相关性。采用微生物组集合商优化(mEQO)工具,我们识别出由八种生物组成的一个集合,其组合丰度与N2O通量的相关性最佳。总体而言,我们的结果表明,N2O通量并非由单一分类单元的变化所驱动,而是由活跃微生物不断变化的集合体所驱动,这些微生物的综合功能潜力支撑了持续稳定的排放。本研究采用了一种新的概念与方法学框架,明确聚焦于活跃微生物群落而非整个群落;如果我们关于N2O通量速率与一个生物集合相关的观察能够得到广泛证实,那么将反硝化作用界定为一种群落性状,或可提高对这一关键过程的可预测性。
一氧化二氮(N2O)是一种强效温室气体,且主要由不完全反硝化作用产生。尽管我们已知许多参与反硝化的微生物物种,但仍无法可靠地预测土壤中的 N2O 产生。微生物生态学的最新研究表明,当将关键微生物视为功能集合体的成员而非彼此孤立的个体时,将其活性与涌现性质联系起来的预测能力会显著提高。我们假设,在 N2O 高产期间,活跃的微生物群落在分类学上有别于不活跃部分;并且,N2O 产生速率的升高与多个活跃类群丰度的共同增加之间的相关性,将强于与某一单一活跃物种占优势之间的相关性。我们进行了一个微宇宙实验,将农田土壤置于厌氧小瓶中培养长达 15 小时,同时追踪 N2O 的产生。通过使用生物正交非经典氨基酸标记技术,并结合荧光激活细胞分选和 16S rRNA 扩增子测序(BONCAT-FACS-Seq),我们在整个培养期间探测了微生物群落中的活跃子集。对 16S rRNA 基因扩增子的分析显示,活跃组分与不活跃组分包含不同的类群,且活跃组分的分类组成会随时间发生变化。我们发现,不足 1% 的微生物群落便可导致高达 3.84 ug N2O-N g dry soil-1 hr-1 的 N2O 通量速率。活性水平(活跃细胞的中位荧光强度)与 N2O 产生速率表现出良好的相关性。我们使用微生物组集合商优化(mEQO)工具鉴定出一个由 8 种生物组成的集合,其组合丰度与 N2O 通量的相关性最佳。总体而言,我们的结果表明,驱动 N2O 通量的并非单一类群的变化,而是活跃微生物集合的动态更替;这些微生物的综合功能潜力支撑了持续的排放。本研究采用了一种新颖的概念与方法学框架,明确聚焦于活跃微生物群落而非整个群落;如果我们关于 N2O 通量速率与一个生物集合相关的观察得到广泛验证,那么将反硝化作用界定为一种群落性状,可能会提高对这一关键过程的可预测性。
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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.10.737762v1?rss=1
🏷️ 土壤微生物 氧化亚氮 反硝化作用 BONCAT-FACS 活跃群落 微生物生态