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长双歧杆菌（Bifidobacterium longum，Bl.）是生命早期肠道中的关键共生菌，但其进化起源及其亚种全球生物地理分布所依据的机制仍未得到充分解析。在此，我们构建了一个全球基因组图谱，汇集了来自婴儿、家养动物、非人灵长类以及古代人类的7,000余个宏基因组组装基因组（MAGs）/基因组。高分辨率系统发育基因组学和功能分析将婴儿相关亚种扩展为五个。与非人灵长类相比，长双歧杆菌在家养动物以及距今150至1,500年的古代人类中更为普遍。此外，来源于同一地理区域的人类和家畜谱系聚类在一起，提示可能存在宿主相关传播。 在生态学层面，Bl. infantis和Bl. longum分别在非西方和西方婴儿中占优势，这一现象独立于母乳喂养、分娩方式或抗生素暴露。相反，它们的分布与共现微生物以及由人乳低聚糖（HMO）驱动的交叉喂养相互作用有关。这些发现解释了西方与非西方婴儿肠道微生物群中亚种分化的原因，并为生命早期基于群落介导的干预提供了理论框架。
婴儿中长双歧杆菌亚种受生活方式分层主导的形成：进化历史与微生物交叉馈养的共同作用 | bioRxiv
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进化历史与微生物交叉馈养塑造婴儿中长双歧杆菌亚种按生活方式分层的优势格局
Wei Guo， Wen Zhang， Lili Yang， Trine Zachariasen， Xuanji Li， Jakob Stokholm， Min Dai， Jonathan Thorsen， Søren Johannes Sørensen， Urvish Trivedi
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.13.737801
Wei Guo 1 丹麦哥持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议 发布。
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发布于 2026 年 7 月 13 日。
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Wei Guo， Wen Zhang， Lili Yang， Trine Zachariasen， Xuanji Li， Jakob Stokholm， Min Dai， Jonathan Thorsen， Søren Johannes Sørensen， Urvish Trivedi
bioRxiv 2026.07.13.737801； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.13.737801
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进化历史与微生物交叉馈养塑造婴儿中长双歧杆菌亚种按生活方式分层的优势格局
Wei Guo， Wen Zhang， Lili Yang， Trine Zachariasen， Xuanji Li， Jakob Stokholm， Min Dai， Jonathan Thorsen， Søren Johannes Sørensen， Urvish Trivedi
bioRxiv 2026.07.13.737801； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.13.737801
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.13.737801v1?rss=1
🏷️ 长双歧杆菌 婴儿肠道微生物群 系统发育基因组学 微生物交叉喂养 人乳低聚糖 宿主传播